35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1042 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1042  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 414 aa  856    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871052  decreased coverage  0.00000000000772318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2627  phosphate-selective porin O and P  65.79 
 
 		 417 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00186911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3329  phosphate-selective porin O and P  52.35 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000579817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4037  phosphate-selective porin O and P  46.26 
 
 		 426 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4128  phosphate-selective porin O and P  46.96 
 
 		 426 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.611373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2208  phosphate-selective porin O and P  25.67 
 
 		 406 aa  90.1  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.743142  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02677  Phosphate-selective porin O and P  25.45 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  23.73 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1375  hypothetical protein  27.46 
 
 		 610 aa  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5308  phosphate-selective porin O and P  23.06 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0811  phosphate-selective porin O and P  27.94 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  23.36 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  23.89 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3355  phosphate-selective porin O and P  20.96 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  24.52 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  24.95 
 
 		 448 aa  53.9  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  23.7 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  23.21 
 
 		 539 aa  50.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  23.85 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  23.53 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  25.16 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  25.16 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  25.16 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  25.16 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  26.01 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  23.68 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  22.91 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  22.78 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  27.56 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  26.88 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4495  phosphate-selective porin O and P  25.37 
 
 		 554 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2384  hypothetical protein  23.27 
 
 		 450 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1382  hypothetical protein  20.63 
 
 		 379 aa  43.1  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0246633 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2296  hypothetical protein  23.27 
 
 		 448 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.744575  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  22.86 
 
 		 437 aa  43.1  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>