More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3421 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3421  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
400 aa  811    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.909101  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1685  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.58 
 
 
405 aa  482  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.888348  normal  0.418034 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5431  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.87 
 
 
407 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.82 
 
 
399 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3900  serine palmitoyltransferase  50.13 
 
 
400 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673344  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44240  8-amino-7-oxononanoate synthase-like protein  54.7 
 
 
391 aa  388  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2171  glycine C-acetyltransferase  49.37 
 
 
400 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.515105  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.49 
 
 
395 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3111  serine palmitoyltransferase  46.35 
 
 
399 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  49.23 
 
 
390 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  49.23 
 
 
390 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  49.23 
 
 
390 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  49.23 
 
 
390 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  49.23 
 
 
390 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.23 
 
 
390 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3076  serine palmitoyltransferase  49.23 
 
 
393 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473722  normal  0.645206 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  42 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  42.3 
 
 
428 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  40.39 
 
 
401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  38.83 
 
 
396 aa  280  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  39.53 
 
 
403 aa  275  8e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1967  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.14 
 
 
400 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2306  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.14 
 
 
404 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.44 
 
 
384 aa  263  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2203  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.29 
 
 
400 aa  264  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  38.83 
 
 
401 aa  262  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2152  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.14 
 
 
404 aa  260  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00977448  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2579  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.36 
 
 
400 aa  259  6e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0257  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.63 
 
 
400 aa  258  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1635  Glycine C-acetyltransferase  41.99 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.61 
 
 
395 aa  253  3e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0804  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.76 
 
 
402 aa  249  9e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145956  normal  0.0180987 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.84 
 
 
391 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.16 
 
 
404 aa  246  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02519  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.5 
 
 
402 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.253704  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0226  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.45 
 
 
401 aa  244  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4805  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.74 
 
 
400 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.730908  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.56 
 
 
396 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2658  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.21 
 
 
396 aa  242  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1598  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.22 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2235  glycine C-acetyltransferase  35.03 
 
 
424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.02 
 
 
388 aa  240  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  31.82 
 
 
395 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  33.71 
 
 
416 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4009  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.34 
 
 
398 aa  236  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0774739  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0961  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.47 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.185356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.5 
 
 
391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.31 
 
 
395 aa  233  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.31 
 
 
395 aa  233  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.39 
 
 
393 aa  232  9e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.75 
 
 
397 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  35.59 
 
 
446 aa  229  8e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4803  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.2 
 
 
400 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.6 
 
 
389 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4366  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.92 
 
 
400 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000326291  normal  0.183649 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3021  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.92 
 
 
399 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0352  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.77 
 
 
397 aa  226  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0688  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.32 
 
 
396 aa  225  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0101  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.08 
 
 
397 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4407  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.79 
 
 
395 aa  223  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.54 
 
 
395 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.04 
 
 
391 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3179  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.22 
 
 
399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.9 
 
 
384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.99 
 
 
391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0748  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.05 
 
 
396 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00398054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.15 
 
 
389 aa  222  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.05 
 
 
396 aa  222  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.05 
 
 
396 aa  222  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0675  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.05 
 
 
396 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36128e-18 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7004  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.12 
 
 
399 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4680  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.05 
 
 
396 aa  222  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.721634  hitchhiker  3.77656e-21 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001212  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.23 
 
 
397 aa  222  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.75 
 
 
399 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.73 
 
 
392 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0534  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.05 
 
 
396 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  35 
 
 
396 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0443  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.21 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2930  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.15 
 
 
397 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.573934  normal  0.531158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0533  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.67 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.801462  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0481  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.31 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0586  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.78 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0620  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.78 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0698  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.06 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3709  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.33 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556629  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0657  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.05 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4159  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.12 
 
 
399 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2225  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.15 
 
 
395 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0098  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.58 
 
 
397 aa  219  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  hitchhiker  0.000233483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4536  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.95 
 
 
399 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  32.21 
 
 
395 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10031  8-amino-7-oxononanoate synthase bioF2  38.77 
 
 
771 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.863563  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.45 
 
 
395 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.41 
 
 
399 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2922  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.57 
 
 
402 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5158  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.95 
 
 
399 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5701  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.95 
 
 
399 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514262 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  32.07 
 
 
391 aa  218  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.83 
 
 
397 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000130332  hitchhiker  0.000000319123 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.06 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>