38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0119 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.53 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.74 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.53 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.08 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  29.94 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.54 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.94 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.58 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.13 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.63 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.88 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.2 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.91 
 
 		 312 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.25 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.94 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.89 
 
 		 317 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.94 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.28 
 
 		 302 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.3 
 
 		 332 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.36 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.92 
 
 		 314 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  28.28 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.7 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.26 
 
 		 207 aa  44.7  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  25.95 
 
 		 258 aa  44.7  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.96 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.81 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30 
 
 		 315 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.81 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  25.79 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.9 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.56 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30 
 
 		 315 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1760  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.28 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  21.95 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.97 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>