More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4069 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4069  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
191 aa  373  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269841  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  76.24 
 
 
187 aa  271  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  75.29 
 
 
192 aa  258  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  74.16 
 
 
179 aa  249  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  69.78 
 
 
191 aa  239  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6936  orotate phosphoribosyltransferase  70.93 
 
 
184 aa  222  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.824462  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38490  orotate phosphoribosyltransferase  71.43 
 
 
189 aa  218  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  67.04 
 
 
178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0125  orotate phosphoribosyltransferase  66.47 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  60.85 
 
 
191 aa  210  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0130  orotate phosphoribosyltransferase  65.9 
 
 
179 aa  209  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000251206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  61.14 
 
 
174 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05620  orotate phosphoribosyltransferase  65.92 
 
 
185 aa  203  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0920693  normal  0.821582 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  57.51 
 
 
195 aa  203  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0181  orotate phosphoribosyltransferase  62.57 
 
 
178 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3147  orotate phosphoribosyltransferase  62.09 
 
 
192 aa  202  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  56.02 
 
 
194 aa  201  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  61.29 
 
 
188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  61.36 
 
 
178 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  58.76 
 
 
194 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2425  orotate phosphoribosyltransferase  65.38 
 
 
191 aa  193  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.205434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4786  orotate phosphoribosyltransferase  61.42 
 
 
199 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35310  orotate phosphoribosyltransferase  66.3 
 
 
197 aa  191  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.238269  normal  0.306388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  58.52 
 
 
177 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3008  orotate phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 
177 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8390  orotate phosphoribosyltransferase  58.73 
 
 
191 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353067 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25780  orotate phosphoribosyltransferase  52.55 
 
 
199 aa  179  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2123  orotate phosphoribosyltransferase  53.54 
 
 
196 aa  166  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1154  orotate phosphoribosyltransferase  41.28 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1938  orotate phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
182 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  40.23 
 
 
187 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  40.23 
 
 
185 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
187 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
187 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  38.62 
 
 
203 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  39.87 
 
 
184 aa  117  7e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  38.98 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1637  orotate phosphoribosyltransferase  38.95 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2069  orotate phosphoribosyltransferase  38.51 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372282  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  37.79 
 
 
183 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  38.98 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1305  orotate phosphoribosyltransferase  41.57 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  38.98 
 
 
198 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1176  orotate phosphoribosyltransferase  41.56 
 
 
195 aa  109  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
185 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  37.71 
 
 
208 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3634  orotate phosphoribosyltransferase  41.32 
 
 
189 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.274017  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5105  orotate phosphoribosyltransferase  42.47 
 
 
193 aa  105  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.077972  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3568  orotate phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
189 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0180203  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5893  phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
193 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
193 aa  104  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
201 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
201 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3708  orotate phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
190 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1455  orotate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
185 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3103  orotate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
187 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 
187 aa  101  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3177  orotate phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 
184 aa  101  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  39.35 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2328  orotate phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
182 aa  98.2  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1892  orotate phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
182 aa  98.2  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
190 aa  97.8  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  97.4  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3689  orotate phosphoribosyltransferase  38.02 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.477212  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 
191 aa  96.3  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03021  orotate phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.0000452779  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  38.55 
 
 
202 aa  95.1  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
185 aa  94.7  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
187 aa  92.8  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
185 aa  92.8  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  30.9 
 
 
185 aa  89  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
186 aa  89  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  32 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 
179 aa  87.8  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  33.87 
 
 
204 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  36.53 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  39.6 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03081  orotate phosphoribosyltransferase  31.87 
 
 
192 aa  84.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.691934  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5503  orotate phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 
192 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5123  orotate phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 
192 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5212  orotate phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 
192 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24961  orotate phosphoribosyltransferase  35.33 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
193 aa  82  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  35.63 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03551  orotate phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1641  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>