More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0166 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  100 
 
 		 297 aa  596  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  61.34 
 
 		 300 aa  291  9e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  55.43 
 
 		 290 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  54.69 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  51.16 
 
 		 283 aa  238  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0640  peptidase S49  54.74 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  54.02 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  50 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  50 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  56.9 
 
 		 287 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  48.16 
 
 		 286 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2523  peptidase S49  50.85 
 
 		 265 aa  225  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  57.75 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2589  peptidase S49  51.6 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901075  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  51.65 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  49.79 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0725  peptidase S49  47.92 
 
 		 300 aa  218  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  51.6 
 
 		 267 aa  218  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  46.74 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  46.57 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1235  peptidase S49  47.96 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  50.21 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  47.57 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  56.02 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  46.04 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  53.74 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  46.94 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1217  peptidase S49  50.55 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  46.3 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  46.94 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  53.1 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  52.21 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  48.33 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  48.33 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  44.4 
 
 		 265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  47.47 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.85 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.15 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.54 
 
 		 329 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  41.3 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  38.61 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  37.7 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.29 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2055  peptidase S49  53.01 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.360179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.55 
 
 		 339 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  39.92 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  41.11 
 
 		 378 aa  175  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.38 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  39.16 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0098  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.21 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2084  signal peptide peptidase  38.77 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1193  peptidase S49  44.65 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.200797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.73 
 
 		 350 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.45 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  40.32 
 
 		 364 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  40.16 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  37.26 
 
 		 329 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  39.84 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.7 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  38.71 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  40.32 
 
 		 364 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  43.64 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  41.78 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  39.43 
 
 		 387 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  39.84 
 
 		 394 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.08 
 
 		 357 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  40.39 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1966  peptidase S49  47.81 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1713  hypothetical protein  41.15 
 
 		 318 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1713  hypothetical protein  41.15 
 
 		 318 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  40.74 
 
 		 325 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  39.26 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  39.75 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1356  peptidase S49  40.36 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  40.09 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  39.34 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  39.34 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  39.34 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  41.12 
 
 		 361 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  40.85 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  39.58 
 
 		 333 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  38.58 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  38.58 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  39.15 
 
 		 360 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  38.98 
 
 		 333 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  38.98 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  38.98 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  38.98 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  38.98 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  38.98 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  38.72 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  40.76 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  39.62 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  39.92 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0925  peptidase S49  40.19 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.474149 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1144  peptidase S49  37.13 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.148766  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  40.09 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  38.43 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  36.11 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4784  peptidase S49  38.79 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.499589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>