32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2465 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2465  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  251  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000067501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1752  hypothetical protein  92.8 
 
 		 125 aa  233  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1127  hypothetical protein  57.26 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1217  hypothetical protein  57.26 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2670  hypothetical protein  57.26 
 
 		 125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.847903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2838  hypothetical protein  54.84 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0570  hypothetical protein  52.42 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0402  hypothetical protein  54.03 
 
 		 125 aa  140  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000320565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2895  hypothetical protein  59.77 
 
 		 223 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  31.58 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  27.62 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  36.76 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  25.47 
 
 		 195 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  31.31 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  31.31 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  30.3 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  30.21 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  32.35 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  25.24 
 
 		 189 aa  45.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  29.29 
 
 		 187 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  29.29 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  25.71 
 
 		 192 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  28.28 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  28.28 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  28.28 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  28.28 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  26.6 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  24 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  26.26 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  26.6 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  22.33 
 
 		 189 aa  40.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>