More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0065 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  100 
 
 
308 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  98.05 
 
 
308 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  80.98 
 
 
307 aa  477  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  81.31 
 
 
307 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  81.31 
 
 
307 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  81.31 
 
 
307 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  81.31 
 
 
307 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  81.64 
 
 
307 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  81.31 
 
 
307 aa  457  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  80.33 
 
 
307 aa  454  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  80.98 
 
 
307 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  80.98 
 
 
307 aa  455  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  70.03 
 
 
310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  80.66 
 
 
307 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  68.4 
 
 
310 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  68.4 
 
 
310 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  64.67 
 
 
312 aa  391  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  65.8 
 
 
307 aa  393  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  68.2 
 
 
306 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  63.33 
 
 
312 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  64.57 
 
 
307 aa  368  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  62.95 
 
 
307 aa  362  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  66 
 
 
307 aa  362  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  66.78 
 
 
306 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  62.66 
 
 
308 aa  354  8.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  63.48 
 
 
306 aa  354  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  65.79 
 
 
308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  65.16 
 
 
309 aa  351  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  64.67 
 
 
302 aa  349  4e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  63.67 
 
 
305 aa  349  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  60.86 
 
 
305 aa  346  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  60.53 
 
 
305 aa  345  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  60.53 
 
 
305 aa  345  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  60.53 
 
 
305 aa  345  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  62.21 
 
 
310 aa  345  5e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  58.9 
 
 
311 aa  345  7e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  61.76 
 
 
324 aa  345  8e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  59.87 
 
 
305 aa  344  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  59.87 
 
 
305 aa  344  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  59.87 
 
 
305 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  59.87 
 
 
305 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  60.2 
 
 
305 aa  344  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  59.87 
 
 
305 aa  343  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  60.78 
 
 
311 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  60.69 
 
 
307 aa  342  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  59.87 
 
 
305 aa  342  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  62.78 
 
 
310 aa  340  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  63.23 
 
 
309 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  59.46 
 
 
305 aa  339  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  61.89 
 
 
308 aa  338  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  58.31 
 
 
306 aa  338  5.9999999999999996e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  61.97 
 
 
310 aa  338  8e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  61.11 
 
 
327 aa  338  9e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  60.59 
 
 
326 aa  338  9e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  60.59 
 
 
326 aa  338  9e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  58.86 
 
 
321 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  59.29 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  59.62 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  58.97 
 
 
327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  60.33 
 
 
311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  60.8 
 
 
308 aa  335  5e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  55.81 
 
 
304 aa  335  5.999999999999999e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  60.46 
 
 
327 aa  335  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  60.26 
 
 
325 aa  335  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  58.69 
 
 
311 aa  334  9e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  60.52 
 
 
320 aa  334  9e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  59.47 
 
 
309 aa  334  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  60.26 
 
 
308 aa  332  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  57.24 
 
 
304 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  58.53 
 
 
301 aa  331  9e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  59.74 
 
 
330 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  59.55 
 
 
309 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  61.84 
 
 
311 aa  330  2e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  63.61 
 
 
309 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  57.38 
 
 
309 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  57.84 
 
 
311 aa  329  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  56.42 
 
 
306 aa  329  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  62.42 
 
 
311 aa  329  4e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  57.43 
 
 
305 aa  329  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  57.38 
 
 
309 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  57.38 
 
 
309 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  57.38 
 
 
309 aa  328  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  63.28 
 
 
309 aa  328  9e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  59.87 
 
 
309 aa  328  9e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  58.17 
 
 
311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  58.82 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  58.52 
 
 
320 aa  327  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  59.93 
 
 
305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  59.93 
 
 
305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  54.93 
 
 
307 aa  326  3e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  56.76 
 
 
305 aa  326  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  62.75 
 
 
311 aa  325  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  57.89 
 
 
309 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  59.74 
 
 
308 aa  325  8.000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  56.08 
 
 
305 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  61.49 
 
 
320 aa  323  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  60 
 
 
309 aa  323  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  58.63 
 
 
311 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  59.35 
 
 
310 aa  323  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  55.07 
 
 
302 aa  323  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>