More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2625 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 92 aa  189  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  92.22 
 
 		 91 aa  175  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  91.01 
 
 		 91 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  84.27 
 
 		 100 aa  161  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  78.41 
 
 		 94 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  77.27 
 
 		 94 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  69.66 
 
 		 101 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  67.42 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 98 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  51.81 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 91 aa  87  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  56.34 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2201  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00183018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2140  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00329854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2123  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000110914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2363  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2382  transcriptional regulator, ArsR family  41.76 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2393  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0242789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2463  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000234537  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02390  regulatory protein ArsR  45.16 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2996  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00129565  normal  0.033071 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2328  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2171  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0439276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2987  regulatory protein ArsR  43.01 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 100 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 100 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0221  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0052  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.135929  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  48.15 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0200  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0013228  hitchhiker  4.7495300000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5558  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0244  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10115e-49 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  38.96 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  38.96 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2840  transcriptional repressor PagR  40.24 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.660839  hitchhiker  0.0000000107753 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5478  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 97 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.350529  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1906  regulatory protein ArsR  39.77 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.186553  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  45.21 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0145  transcriptional repressor PagR, putative  41.98 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0207  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.239951  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0320  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0127  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196561  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0268  transcriptional repressor PagR  41.98 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0048  transcriptional regulator, ArsR family protein  38.55 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0663056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3439  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3065  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0069  transcriptional repressor PagR  40 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3120  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3305  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  38.27 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0166  transcriptional repressor PagR  38.82 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2343  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3450  regulatory protein ArsR  37.11 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  37.8 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  35.63 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  44.87 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>