55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1997 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1997  PDZ domain-containing protein  100 
 
 		 433 aa  863    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0347733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2049  hypothetical protein  70.86 
 
 		 433 aa  618  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101437  hitchhiker  0.0000000146402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1774  hypothetical protein  68.46 
 
 		 430 aa  598  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0981  protein of unknown function DUF512  66.2 
 
 		 432 aa  559  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000360347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3279  protein of unknown function DUF512  65.5 
 
 		 432 aa  556  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2966  hypothetical protein  60.61 
 
 		 436 aa  542  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0640841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0990  protein of unknown function DUF512  56.51 
 
 		 444 aa  463  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000932101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1984  hypothetical protein  41.71 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1159  hypothetical protein  46.34 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000801932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1883  FeS-containing oxidoreductase  45.84 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1173  hypothetical protein  46.14 
 
 		 451 aa  352  5e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1025  hypothetical protein  40.19 
 
 		 445 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0603945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1631  protein of unknown function DUF512  41.1 
 
 		 454 aa  343  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  42.62 
 
 		 440 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2132  protein of unknown function DUF512  40.23 
 
 		 438 aa  341  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00526746  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2331  Fe-S oxidoreductase  44.66 
 
 		 465 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1323  hypothetical protein  44.11 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2244  FeS-containing oxidoreductase  41.61 
 
 		 453 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2296  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  41.61 
 
 		 453 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00042763  normal  0.0619176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0632  hypothetical protein  42.4 
 
 		 446 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1326  Fe-S oxidoreductase  39.5 
 
 		 451 aa  325  7e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1968  hypothetical protein  41.69 
 
 		 452 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.161355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0359  Fe-S oxidoreductase  42.42 
 
 		 465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3382  protein of unknown function DUF512  41.36 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.322973  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2541  FeS-containing oxidoreductase  41.57 
 
 		 448 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0459  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  41.77 
 
 		 441 aa  315  8e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2391  hypothetical protein  36.66 
 
 		 450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000589442  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  41.23 
 
 		 449 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01681  putative Fe-S oxidoreductase  41 
 
 		 449 aa  309  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.911896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02221  putative Fe-S oxidoreductase  41.57 
 
 		 465 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01111  putative Fe-S oxidoreductase  38.41 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.980262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1727  hypothetical protein  37.32 
 
 		 445 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.519845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2009  hypothetical protein  37.32 
 
 		 445 aa  302  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01141  putative Fe-S oxidoreductase  37.41 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0750  protein of unknown function DUF512  38.42 
 
 		 433 aa  300  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1225  protein of unknown function DUF512  43.56 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.767388  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01131  putative Fe-S oxidoreductase  37.35 
 
 		 459 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.104938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4507  hypothetical protein  40.68 
 
 		 456 aa  292  7e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01101  putative Fe-S oxidoreductase  36.56 
 
 		 470 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.277769  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0102  putative Fe-S oxidoreductase  36.71 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.383242  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0401  protein of unknown function DUF512  40.37 
 
 		 487 aa  280  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2144  hypothetical protein  37.81 
 
 		 501 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3528  hypothetical protein  37.5 
 
 		 515 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2747  protein of unknown function DUF512  36.53 
 
 		 508 aa  270  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3571  hypothetical protein  34.31 
 
 		 523 aa  262  6.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.630428  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0727  protein of unknown function DUF512  32.82 
 
 		 460 aa  229  6e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0961895 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09690  Fe-S oxidoreductase  34.41 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1336  protein of unknown function DUF512  35.04 
 
 		 477 aa  213  5.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.506965 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  34.22 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0304  hypothetical protein  34.02 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.874468 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1348  protein of unknown function DUF512  37.73 
 
 		 450 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0022  hypothetical protein  21.2 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0801  hypothetical protein  21.11 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1316  hypothetical protein  32.88 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 345 aa  43.1  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.158683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>