195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3611 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  100 
 
 
216 aa  440  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  96.71 
 
 
214 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  70.62 
 
 
214 aa  304  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  69.05 
 
 
213 aa  296  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  65.4 
 
 
213 aa  295  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  58.85 
 
 
214 aa  245  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  62.05 
 
 
211 aa  241  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.95 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  48.45 
 
 
215 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.45 
 
 
215 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  48.31 
 
 
209 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  48.31 
 
 
209 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.41 
 
 
207 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  46.45 
 
 
211 aa  185  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.66 
 
 
211 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  46.89 
 
 
225 aa  173  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  42.79 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  48.24 
 
 
224 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.51 
 
 
213 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  48.19 
 
 
239 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.72 
 
 
214 aa  168  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.93 
 
 
226 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  41.4 
 
 
227 aa  164  8e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  41.26 
 
 
207 aa  164  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2161  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.89 
 
 
228 aa  161  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.2 
 
 
205 aa  160  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  45.15 
 
 
224 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  43.07 
 
 
217 aa  158  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  44.34 
 
 
219 aa  157  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  44.5 
 
 
219 aa  155  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  39.72 
 
 
225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  44.23 
 
 
534 aa  151  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1022  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.15 
 
 
229 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535258  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  44.71 
 
 
468 aa  149  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.65 
 
 
228 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  42.11 
 
 
220 aa  148  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.2 
 
 
212 aa  148  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  40.78 
 
 
207 aa  147  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.36 
 
 
541 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.07 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.71 
 
 
520 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0440  precorrin-8X methylmutase, precorrin isomerase  42.58 
 
 
225 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.46496  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0475  precorrin-8X methylmutase  42.58 
 
 
225 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.8 
 
 
230 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.91 
 
 
451 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.26 
 
 
245 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  38.1 
 
 
211 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2202  cobalt-precorrin-8X methylmutase  43.98 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2255  cobalt-precorrin-8X methylmutase  43.98 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.463985 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.93 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2155  cobalt-precorrin-8X methylmutase  43.98 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2209  cobalt-precorrin-8X methylmutase  43.52 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.185251  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2368  cobalt-precorrin-8X methylmutase  43.52 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.67 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.78 
 
 
222 aa  131  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.49 
 
 
469 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  39.41 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  36.36 
 
 
201 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.71 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  39.71 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  35.41 
 
 
200 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  39.3 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  34 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.71 
 
 
472 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0645  precorrin-8X methylmutase  39.58 
 
 
199 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000995367  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  36.95 
 
 
212 aa  122  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1287  precorrin-8X methylmutase  35.98 
 
 
203 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01573  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1349  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.86 
 
 
222 aa  122  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  39.09 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  38.42 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  39.11 
 
 
230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  35.94 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  34.9 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  35.42 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  37.88 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6032  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.02 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  35.47 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  38.24 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  37.13 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  37.75 
 
 
208 aa  111  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  38.3 
 
 
209 aa  111  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  37.56 
 
 
209 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  38.62 
 
 
209 aa  106  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  36.68 
 
 
210 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  36.45 
 
 
209 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  37.43 
 
 
215 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  35.85 
 
 
208 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  37.19 
 
 
210 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  35.86 
 
 
208 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  37.25 
 
 
208 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4884  precorrin-8X methylmutase  40.21 
 
 
208 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  37.25 
 
 
208 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4618  precorrin-8X methylmutase  40.21 
 
 
208 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  37.25 
 
 
208 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4828  precorrin-8X methylmutase  40.21 
 
 
208 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.504707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  37.86 
 
 
209 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4706  precorrin-8X methylmutase  40.21 
 
 
208 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  37.97 
 
 
210 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3745  precorrin-8X methylmutase  33.5 
 
 
208 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.106474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  38.61 
 
 
210 aa  101  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>