135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1695 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
181 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  46.33 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  45.35 
 
 
180 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.62 
 
 
171 aa  140  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.11 
 
 
174 aa  138  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.34 
 
 
175 aa  137  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  40.24 
 
 
175 aa  124  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.41 
 
 
180 aa  123  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.16 
 
 
170 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.46 
 
 
176 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.86 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.72 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.05 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  37.57 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.58 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.56 
 
 
133 aa  90.1  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.94 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.88 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.22 
 
 
407 aa  81.3  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.43 
 
 
462 aa  80.9  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  29.48 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  33.55 
 
 
344 aa  74.3  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.55 
 
 
352 aa  74.3  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.3 
 
 
175 aa  58.5  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  29.57 
 
 
385 aa  55.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.43 
 
 
407 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2716  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.81 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.653376  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  30.34 
 
 
344 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1214  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.04 
 
 
100 aa  55.1  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0826897  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2811  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.23 
 
 
171 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647947  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  25.54 
 
 
185 aa  54.7  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.22 
 
 
412 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.82 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.71 
 
 
412 aa  52  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4108  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.91 
 
 
169 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.629553  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.26 
 
 
405 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.78 
 
 
330 aa  50.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3645  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.67 
 
 
143 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301745  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  28.03 
 
 
403 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0366  putative inner membrane protein  27.72 
 
 
404 aa  49.7  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  26.14 
 
 
375 aa  49.7  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  28.81 
 
 
366 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  27.04 
 
 
359 aa  48.9  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0587  putative inner membrane protein  29.2 
 
 
405 aa  48.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  29.3 
 
 
359 aa  48.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  29.3 
 
 
359 aa  48.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  30.72 
 
 
401 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1618  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44 
 
 
137 aa  47.8  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000269171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.92 
 
 
159 aa  47.8  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  30.72 
 
 
401 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  30.72 
 
 
401 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  30.72 
 
 
401 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  30.72 
 
 
401 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  26.55 
 
 
402 aa  47.8  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2630  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.59 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  26.55 
 
 
402 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2895  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.67 
 
 
141 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0556  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.08 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0358  YeeE/YedE family protein  46.94 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0829  putative inner membrane protein  26.8 
 
 
406 aa  46.6  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  23.16 
 
 
343 aa  46.6  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1899  YeeE/YedE family protein  46.94 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279304  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1813  YeeE/YedE family protein  46.94 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.86 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  26.55 
 
 
402 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.46 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  32.94 
 
 
139 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.11 
 
 
415 aa  45.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  27.04 
 
 
352 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0812  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.25 
 
 
145 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.938577  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4076  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.09 
 
 
143 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0200066  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  43.14 
 
 
144 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.42 
 
 
334 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  25.85 
 
 
455 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2423  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.49 
 
 
174 aa  44.7  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.27 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  26.42 
 
 
349 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2519  hypothetical protein  26.5 
 
 
144 aa  44.7  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  23.93 
 
 
185 aa  44.7  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  26.42 
 
 
352 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19730  putative inner membrane protein  28.48 
 
 
415 aa  44.3  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.0148656 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  26.42 
 
 
352 aa  44.3  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000102  DUF395 domain-containing protein  31.43 
 
 
139 aa  44.3  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  26.42 
 
 
352 aa  44.3  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  28.39 
 
 
404 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0742  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  28.39 
 
 
404 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  28.39 
 
 
404 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  28.39 
 
 
404 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  28.29 
 
 
423 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.04 
 
 
352 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.11 
 
 
371 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2818  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.95 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0425714  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2899  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0203  YeeE/YedE family protein  44.9 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1403  YeeE/YedE family protein  44.9 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.14374  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0585  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0855  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000829035 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.91 
 
 
404 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>