257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1458 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 114 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0753  XRE family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.057083  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0019  XRE family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0558597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0447  transcriptional regulator, XRE family  33.06 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2159  Cro/CI family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00000314405  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0026  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2071  Cro/CI family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0247654  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0595  XRE family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.958783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0237  XRE family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0443  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000554716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3923  XRE family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.680179  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1815  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843474  normal  0.166838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0016  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000711578 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1248  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.821781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0051  XRE family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3622  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0230  transcriptional regulator, XRE family  34.75 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737224  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0154  helix-turn-helix domain-containing protein  35.45 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0473  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0066  XRE family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0319384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3177  XRE family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0647326  normal  0.0138701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1061  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.161431  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0834  XRE family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211274  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6504  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6091  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0045  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000742068  hitchhiker  0.0000000000614145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  36.45 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4795  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0939257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1563  transcriptional regulator, XRE family  38.39 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7198  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0637638 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0014  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.881591  normal  0.120221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2892  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 166 aa  60.1  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2429  XRE family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6040  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3208  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3762  transcriptional regulator, XRE family  36.61 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4530  XRE family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2959  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676432  normal  0.753241 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9533  transcriptional regulator Cro/CI family  36.36 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140693  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6073  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7073  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0329  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.846996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4834  transcriptional regulator, XRE family  35.51 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.592449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3522  helix-turn-helix domain-containing protein  33.93 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5225  XRE family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3242  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3125  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0026  XRE family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153059  normal  0.660956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1502  XRE family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3038  XRE family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2775  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0021  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1020  XRE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3775  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1232  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236768  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0971  transcriptional regulator, XRE family  34.82 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.508784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2160  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468793  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8067  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.262846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1149  XRE family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.016899  hitchhiker  0.00000234075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2278  XRE family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.504941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2727  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1168  transcriptional regulator, XRE family  34.82 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.092853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1041  helix-turn-helix domain-containing protein  34.82 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0368815 
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  31.68 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2104  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2456  XRE family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.20041 
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  31.58 
 
 		 312 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0155  helix-turn-helix domain-containing protein  38.32 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3578  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3598  XRE family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00212083  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  31.58 
 
 		 303 aa  52  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  30.3 
 
 		 302 aa  51.6  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  38.03 
 
 		 245 aa  51.2  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0894  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 215 aa  51.2  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0230  DNA-binding protein  31.09 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0592162  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1118  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  51.2  0.000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1221  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309245  normal  0.121494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3608  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2384  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  38.03 
 
 		 383 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4093  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4413  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3627  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6134  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2505  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3774  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 94 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0502189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3398  XRE family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3790  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>