More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3125 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3125  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
502 aa  997    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1706  putative aldehyde dehydrogenase  52.11 
 
 
517 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2395  Aldehyde Dehydrogenase  50.61 
 
 
504 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4113  Aldehyde Dehydrogenase  45.49 
 
 
504 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1484  aldehyde dehydrogenase  46.89 
 
 
497 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3335  aldehyde dehydrogenase  46.83 
 
 
489 aa  364  3e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3135  Aldehyde Dehydrogenase  46.44 
 
 
483 aa  359  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.18311 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3869  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
505 aa  353  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5346  Aldehyde Dehydrogenase  46.36 
 
 
485 aa  353  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0811797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1486  aldehyde dehydrogenase  47.37 
 
 
485 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0844  aldehyde dehydrogenase  42.57 
 
 
508 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4865  aldehyde dehydrogenase  43.78 
 
 
504 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0786  Aldehyde Dehydrogenase  49.11 
 
 
502 aa  343  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0369146 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3264  aldehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
508 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000455371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3374  aldehyde dehydrogenase  45.18 
 
 
508 aa  341  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4139  putative semialdehyde dehydrogenase  43.81 
 
 
526 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557422  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1008  Aldehyde Dehydrogenase  44.32 
 
 
536 aa  340  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.69554 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5346  Aldehyde Dehydrogenase  44.84 
 
 
505 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.671468 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3656  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.51 
 
 
508 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0037  aldehyde dehydrogenase  43.41 
 
 
537 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4676  aldehyde dehydrogenase  46.61 
 
 
495 aa  337  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310641  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1743  aldehyde dehydrogenase  46.89 
 
 
502 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0112208  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4441  aldehyde dehydrogenase  43.58 
 
 
526 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3101  aldehyde dehydrogenase  43 
 
 
526 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3952  Aldehyde Dehydrogenase  49.1 
 
 
580 aa  332  8e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2498  Aldehyde Dehydrogenase  43.46 
 
 
549 aa  332  9e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1086  aldehyde dehydrogenase  46.95 
 
 
490 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0121968  decreased coverage  0.00153229 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5410  Aldehyde Dehydrogenase  44.69 
 
 
505 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  decreased coverage  0.00137707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2314  aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 
526 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0433257  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0832  aldehyde dehydrogenase  41.21 
 
 
525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0547808 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6431  aldehyde dehydrogenase  45.03 
 
 
530 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00291714  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1998  aldehyde dehydrogenase  43.68 
 
 
524 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0448113  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2670  aldehyde dehydrogenase  41.35 
 
 
533 aa  327  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3253  aldehyde dehydrogenase  42.7 
 
 
526 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48010  putative semialdehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
526 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014327  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003674  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  39.03 
 
 
510 aa  325  9e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.690417  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3131  aldehyde dehydrogenase  42.04 
 
 
526 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3602  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  43.33 
 
 
526 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133791  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4104  aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 
502 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000295252 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3394  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 
508 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0227  aldehyde dehydrogenase  41.46 
 
 
527 aa  324  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2817  aldehyde dehydrogenase  42.03 
 
 
526 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106118  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1189  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  43.34 
 
 
656 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0042  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  43.34 
 
 
656 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2460  aldehyde dehydrogenase  42.79 
 
 
527 aa  323  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2585  aldehyde dehydrogenase family protein  41.81 
 
 
526 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0035  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  43.34 
 
 
526 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1470  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  43.34 
 
 
526 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0043  aldehyde dehydrogenase  43.34 
 
 
526 aa  323  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0253475  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6713  aldehyde dehydrogenase  45.71 
 
 
529 aa  323  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1541  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  43.34 
 
 
659 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3224  aldehyde dehydrogenase  42.57 
 
 
526 aa  322  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169196  normal  0.562334 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0057  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  43.34 
 
 
526 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4199  aldehyde dehydrogenase  42.92 
 
 
522 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05180  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  41.5 
 
 
525 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3912  dehydrogenase  40.72 
 
 
504 aa  320  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0195751  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0036  aldehyde dehydrogenase  43.42 
 
 
538 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4665  aldehyde dehydrogenase  44.12 
 
 
524 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2306  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
530 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.862226  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2116  aldehyde dehydrogenase  43.06 
 
 
525 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458004  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1760  aldehyde dehydrogenase  40.81 
 
 
521 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000916491  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3713  aldehyde dehydrogenase  42.31 
 
 
525 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4585  Aldehyde Dehydrogenase  44.67 
 
 
523 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414415  normal  0.785416 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4451  Aldehyde Dehydrogenase  44.67 
 
 
523 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49290  Aldehyde dehydrogenase  41.06 
 
 
526 aa  316  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213935  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3325  aldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 
506 aa  315  9e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3399  aldehyde dehydrogenase  41.52 
 
 
525 aa  315  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202581  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2364  aldehyde dehydrogenase  39.11 
 
 
521 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0248212  normal  0.117766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0086  aldehyde dehydrogenase  45.37 
 
 
509 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.932272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3072  putative aldehyde dehydrogenase  42.57 
 
 
527 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36050  putative aldehyde dehydrogenase  42.79 
 
 
527 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0976275  hitchhiker  0.00000000280554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1837  aldehyde dehydrogenase  42.29 
 
 
536 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0038  aldehyde dehydrogenase  40.28 
 
 
526 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4869  aldehyde dehydrogenase  44.72 
 
 
530 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4783  aldehyde dehydrogenase  44.72 
 
 
530 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.233271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3323  aldehyde dehydrogenase family protein  40.4 
 
 
527 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559722  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4947  aldehyde dehydrogenase  41.92 
 
 
525 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2442  NADP-dependent fatty aldehyde dehydrogenase  43.08 
 
 
501 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1283  aldehyde dehydrogenase  42.73 
 
 
525 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3624  aldehyde dehydrogenase  41.28 
 
 
525 aa  311  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186491  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1529  fatty aldehyde dehydrogenase  39.74 
 
 
515 aa  310  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3157  aldehyde dehydrogenase  39.6 
 
 
527 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000809211  normal  0.137723 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1140  aldehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
525 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3045  aldehyde dehydrogenase  41.97 
 
 
525 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5321  aldehyde dehydrogenase  41.97 
 
 
525 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5169  aldehyde dehydrogenase  44.2 
 
 
530 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0593368 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5206  aldehyde dehydrogenase  44.05 
 
 
525 aa  309  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4272  Aldehyde Dehydrogenase  39.11 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2289  aldehyde dehydrogenase  37.83 
 
 
525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1256  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
525 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1702  aldehyde dehydrogenase  38.26 
 
 
521 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124447  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0115  aldehyde dehydrogenase  44.22 
 
 
495 aa  307  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5547  aldehyde dehydrogenase  43.49 
 
 
507 aa  307  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0649354 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4679  aldehyde dehydrogenase  43.61 
 
 
525 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0864  aldehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
528 aa  306  6e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.321546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3112  aldehyde dehydrogenase  42.13 
 
 
527 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0350  Aldehyde Dehydrogenase  42.76 
 
 
537 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5736  Aldehyde Dehydrogenase  40.53 
 
 
533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.437114  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1897  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase  41.34 
 
 
527 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.271045  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0328  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  43.83 
 
 
525 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>