More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3901 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  45.48 
 
 		 879 aa  637    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 949 aa  695    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 925 aa  719    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 857 aa  770    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12550  leucyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 985 aa  1002    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220072  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 969 aa  992    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 		 984 aa  1050    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 936 aa  695    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  71.93 
 
 		 1016 aa  1478    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 951 aa  1015    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 971 aa  1042    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 963 aa  1072    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 923 aa  720    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  54.02 
 
 		 949 aa  1050    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 978 aa  1089    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2634  leucyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 969 aa  719    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 906 aa  662    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 978 aa  1013    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 954 aa  1094    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  51.21 
 
 		 994 aa  1004    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 990 aa  1029    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1064 aa  2147    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 958 aa  1025    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 944 aa  709    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1254  leucyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 922 aa  709    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  56.3 
 
 		 952 aa  1066    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 936 aa  807    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 954 aa  716    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 		 971 aa  1041    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 968 aa  1048    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 921 aa  701    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 950 aa  1053    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 934 aa  1035    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 984 aa  1018    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 952 aa  1007    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 		 971 aa  1041    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 987 aa  987    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 968 aa  1046    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 982 aa  1021    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 949 aa  1038    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 838 aa  631  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 805 aa  618  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 802 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 805 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 802 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 802 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 804 aa  600  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 802 aa  602  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 802 aa  600  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 802 aa  602  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 802 aa  602  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 802 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 802 aa  602  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 802 aa  602  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 802 aa  596  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 833 aa  594  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 808 aa  591  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 833 aa  585  1.0000000000000001e-165  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 806 aa  584  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 806 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 854 aa  582  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 858 aa  579  1.0000000000000001e-163  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 805 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 		 805 aa  574  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 		 805 aa  574  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 806 aa  570  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 829 aa  572  1e-161  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 805 aa  566  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 857 aa  566  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 829 aa  563  1.0000000000000001e-159  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 824 aa  560  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 805 aa  560  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 807 aa  561  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 804 aa  559  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 		 830 aa  555  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 824 aa  552  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 816 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 828 aa  543  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 835 aa  538  1e-151  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 840 aa  535  1e-150  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 		 865 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 826 aa  529  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 817 aa  525  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1009  leucyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 816 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 823 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 819 aa  522  1e-146  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 854 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  40.07 
 
 		 899 aa  518  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 813 aa  514  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 814 aa  513  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_182  leucyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 		 813 aa  509  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00206077  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 		 813 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 856 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1280  leucyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 870 aa  504  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 843 aa  501  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 872 aa  497  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 		 858 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 810 aa  493  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3454  leucyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 814 aa  492  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08751  leucyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 872 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.115344  hitchhiker  0.00155899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>