More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2402 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2402  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
371 aa  716    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125714  normal  0.0217633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7544  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.68 
 
 
341 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.166412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3761  Bacitracin resistance protein BacA  58.97 
 
 
295 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461913  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2750  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.14 
 
 
276 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1231  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.58 
 
 
276 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.23 
 
 
297 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  normal  0.172198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1204  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.58 
 
 
276 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1544  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.22 
 
 
276 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1713  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.22 
 
 
276 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.346313  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4462  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.58 
 
 
276 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.240669  normal  0.695003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.58 
 
 
276 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1301  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.58 
 
 
276 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1319  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.58 
 
 
276 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1299  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.94 
 
 
276 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0212  Undecaprenyl-diphosphatase  47.01 
 
 
278 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.629944  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.45 
 
 
276 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1513  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.54 
 
 
276 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0787  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.26 
 
 
277 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0636  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.26 
 
 
277 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16350  Undecaprenyl-diphosphatase  26.67 
 
 
314 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0173909 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1821  undecaprenyl-diphosphatase  39.23 
 
 
271 aa  99  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2837  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.12 
 
 
276 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0491533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0020  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.02 
 
 
280 aa  97.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434672  normal  0.115672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0723  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.96 
 
 
282 aa  97.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.2 
 
 
292 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  42.52 
 
 
272 aa  92.8  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10180  Undecaprenyl-diphosphatase  25.82 
 
 
302 aa  92  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00316113  normal  0.0119767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  42.31 
 
 
264 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.13 
 
 
276 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08750  putative undecaprenol kinase  38.24 
 
 
259 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.951651  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  40.43 
 
 
261 aa  87.4  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  47.17 
 
 
279 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.03 
 
 
276 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.94 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  40.16 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  40.16 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.68 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.02 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.97 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.77 
 
 
292 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0335  undecaprenol kinase  42.75 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395953  normal  0.197846 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.86 
 
 
283 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.75 
 
 
266 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.06 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.86 
 
 
276 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.86 
 
 
282 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.27 
 
 
266 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  38.89 
 
 
273 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.86 
 
 
276 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  38.28 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.07 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.69 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  38.28 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.86 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.17 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1209  undecaprenol kinase  40.6 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  32.39 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.06 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  40.65 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  41.91 
 
 
302 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.17 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.5 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  24.86 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.34 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0163  putative undecaprenol kinase  41.79 
 
 
304 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.714151  normal  0.0225352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  39.86 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.64 
 
 
282 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  38.21 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  43.33 
 
 
262 aa  77  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0282  Undecaprenyl-diphosphatase  47.66 
 
 
291 aa  77  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160611 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0381  Undecaprenyl-diphosphatase  24.26 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.100133  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  37.78 
 
 
322 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  37.78 
 
 
322 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.09 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.22 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.22 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.34 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.22 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.77 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  38.52 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  33.08 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.03 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.61 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.18 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0302  bacitracin resistance protein BacA  38.33 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.425765  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06831  bacitracin resistance protein BacA  33.86 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.834409 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.47 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  38.4 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  39.2 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.74 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.94 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  37.23 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.52 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0945  Undecaprenyl-diphosphatase  25.34 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130471  hitchhiker  0.000579984 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0157  undecaprenyl-diphosphatase  44.95 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.59 
 
 
266 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0848  undecaprenol kinase  41.38 
 
 
307 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.433403  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.35 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.92 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>