More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0020 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0020  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
280 aa  552  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434672  normal  0.115672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0723  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.76 
 
 
282 aa  256  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0787  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.68 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0636  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.68 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1821  undecaprenyl-diphosphatase  40.36 
 
 
271 aa  205  8e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1299  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.42 
 
 
276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.44 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  normal  0.172198 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0212  Undecaprenyl-diphosphatase  45.85 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.629944  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2837  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.05 
 
 
276 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0491533 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1231  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.17 
 
 
276 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1204  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.17 
 
 
276 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4462  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.54 
 
 
276 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.240669  normal  0.695003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1301  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.54 
 
 
276 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.54 
 
 
276 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1319  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.54 
 
 
276 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179901  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2750  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 
276 aa  188  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.45 
 
 
276 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1713  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.34 
 
 
276 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.346313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1513  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.34 
 
 
276 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1544  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.34 
 
 
276 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3761  Bacitracin resistance protein BacA  44.67 
 
 
295 aa  181  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7544  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.22 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.166412 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  37.96 
 
 
269 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1538  undecaprenol kinase, putative  34.15 
 
 
280 aa  144  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.634552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  36.33 
 
 
273 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1525  bacitracin resistance protein BacA  32.36 
 
 
249 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00563996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0394  bacitracin resistance protein BacA  32.73 
 
 
249 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  35.21 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0196  Bacitracin resistance protein BacA  34.07 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0441  bacitracin resistance protein BacA  32.36 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  37.09 
 
 
269 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  34.06 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.09 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0524  undecaprenol kinase  38.1 
 
 
272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.82 
 
 
282 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  34.88 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0466  bacitracin resistance protein BacA  32.84 
 
 
249 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.13617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  35.9 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1174  bacitracin resistance protein BacA  35.64 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.97 
 
 
288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.96 
 
 
278 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  30.63 
 
 
266 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1407  undecaprenol kinase  29.21 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  36.5 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.31 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.29 
 
 
283 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 
282 aa  126  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0788  undecaprenol kinase  31.77 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.878199  normal  0.592274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.9 
 
 
293 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  30 
 
 
266 aa  125  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.97 
 
 
276 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 
277 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  32.47 
 
 
258 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04545  putative undecaprenol kinase  31.27 
 
 
264 aa  125  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3867  undecaprenol kinase  35.4 
 
 
271 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1197  bacitracin resistance protein BacA  31.02 
 
 
247 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0116  Bacitracin resistance protein BacA  32.97 
 
 
293 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0646  bacitracin resistance protein  36.43 
 
 
263 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000570462  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.2 
 
 
312 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.34 
 
 
282 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.74 
 
 
266 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 
277 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.58 
 
 
282 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.66 
 
 
276 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1266  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.02 
 
 
260 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.86 
 
 
266 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.66 
 
 
276 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.66 
 
 
276 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.02 
 
 
276 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.4 
 
 
266 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.77 
 
 
266 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0949  undecaprenyl-diphosphatase  30.22 
 
 
263 aa  122  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497251  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.77 
 
 
266 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3783  undecaprenol kinase  35.16 
 
 
271 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.261565  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.07 
 
 
266 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.77 
 
 
266 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  33.33 
 
 
274 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  36.86 
 
 
272 aa  122  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08750  putative undecaprenol kinase  31.99 
 
 
259 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.951651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  31.75 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.37 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0437  putative undecaprenol kinase  31.67 
 
 
258 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.222159  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  32.35 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.14 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.14 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.66 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  34.3 
 
 
265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  35.13 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.82 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.14 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.14 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  31.58 
 
 
281 aa  120  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0458  undecaprenol kinase  31.9 
 
 
302 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.36 
 
 
267 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31 
 
 
277 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3561  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.58 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0840276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.88 
 
 
292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.02 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.96 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>