More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0282 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0282  Undecaprenyl-diphosphatase  100 
 
 
291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0335  undecaprenol kinase  78.35 
 
 
291 aa  448  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395953  normal  0.197846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  65.74 
 
 
290 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1209  undecaprenol kinase  60.42 
 
 
290 aa  348  7e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2789  undecaprenol kinase  66.9 
 
 
295 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3201  undecaprenol kinase  66.42 
 
 
296 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0946328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.14 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.04 
 
 
288 aa  225  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  45.52 
 
 
320 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  44.72 
 
 
322 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  44.72 
 
 
322 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.42 
 
 
283 aa  196  6e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.14 
 
 
312 aa  195  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.91 
 
 
287 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.88 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  43.87 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.25 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.6 
 
 
282 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  37.27 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06831  bacitracin resistance protein BacA  41.48 
 
 
291 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.834409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.48 
 
 
292 aa  175  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  38.18 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.64 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.3 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09201  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.26 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0131837 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0252  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.79 
 
 
279 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0294819  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.36 
 
 
283 aa  170  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0458  undecaprenol kinase  38.01 
 
 
302 aa  170  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  35.79 
 
 
274 aa  168  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3549  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.89 
 
 
269 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.38 
 
 
266 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  37.87 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.27 
 
 
282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.96 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.39 
 
 
277 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  39.93 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  39.1 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  37.31 
 
 
285 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.32 
 
 
265 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.81 
 
 
286 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.88 
 
 
266 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.78 
 
 
282 aa  159  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  38.28 
 
 
266 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0102  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.26 
 
 
278 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.15 
 
 
272 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
264 aa  156  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.4 
 
 
267 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  40.23 
 
 
273 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  36.73 
 
 
277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  35.86 
 
 
289 aa  155  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.6 
 
 
278 aa  155  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  36.53 
 
 
280 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  38.52 
 
 
269 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  37.21 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.97 
 
 
276 aa  153  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  38.38 
 
 
267 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.5 
 
 
266 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.16 
 
 
276 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.31 
 
 
276 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.87 
 
 
267 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  36.96 
 
 
269 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.31 
 
 
276 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.31 
 
 
282 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  38.4 
 
 
281 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.5 
 
 
266 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.78 
 
 
286 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.55 
 
 
265 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.58 
 
 
266 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.45 
 
 
280 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  37.84 
 
 
281 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.95 
 
 
264 aa  149  7e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  34.69 
 
 
290 aa  149  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  36.08 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3860  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.45 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340187  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.47 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.83 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  36.1 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.59 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.4 
 
 
266 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.4 
 
 
266 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.4 
 
 
266 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  39.06 
 
 
274 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  38.02 
 
 
267 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.4 
 
 
266 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.09 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.77 
 
 
265 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  38.64 
 
 
261 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3867  undecaprenol kinase  37.89 
 
 
271 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  34.34 
 
 
273 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  36.74 
 
 
290 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.79 
 
 
267 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.47 
 
 
266 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.58 
 
 
266 aa  143  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.83 
 
 
266 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  37.12 
 
 
261 aa  143  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09021  bacitracin resistance protein BacA  33.46 
 
 
266 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  36.84 
 
 
281 aa  142  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.46 
 
 
266 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.63 
 
 
278 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.806671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>