More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0335 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0335  undecaprenol kinase  100 
 
 		 291 aa  577  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395953  normal  0.197846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0282  Undecaprenyl-diphosphatase  78.35 
 
 		 291 aa  447  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  67.82 
 
 		 290 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1209  undecaprenol kinase  62.85 
 
 		 290 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2789  undecaprenol kinase  72.13 
 
 		 295 aa  359  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3201  undecaprenol kinase  70.96 
 
 		 296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0946328 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.07 
 
 		 288 aa  252  6e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.41 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  46.44 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  46.38 
 
 		 322 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  46.38 
 
 		 322 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.66 
 
 		 283 aa  209  5e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.51 
 
 		 287 aa  201  8e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.12 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  47.01 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.56 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.57 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06831  bacitracin resistance protein BacA  39.39 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.834409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  39.57 
 
 		 279 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3549  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.85 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.71 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  38.38 
 
 		 386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.52 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.72 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09201  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.19 
 
 		 279 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0131837 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0252  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.19 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0294819  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.58 
 
 		 282 aa  176  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.05 
 
 		 282 aa  175  8e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.37 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  38.81 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.71 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.51 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  37.09 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.77 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  36.14 
 
 		 289 aa  168  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.08 
 
 		 265 aa  168  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0458  undecaprenol kinase  38.29 
 
 		 302 aa  168  9e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.27 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0102  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.97 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.93 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.31 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  39.69 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  39.38 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.2 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  38.66 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.56 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.76 
 
 		 264 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  38.49 
 
 		 270 aa  165  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.7 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  41.58 
 
 		 281 aa  165  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  38.66 
 
 		 272 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  41.3 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.43 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.55 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.53 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.64 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  38.85 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.86 
 
 		 265 aa  159  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.17 
 
 		 277 aa  158  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.55 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  40.62 
 
 		 269 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  40.48 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.02 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.78 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.78 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.78 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.55 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.64 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.26 
 
 		 266 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.82 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  36.61 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.88 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.55 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.26 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  36.52 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.2 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.5 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.806671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  38.43 
 
 		 279 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.7 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.7 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.4 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.7 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.7 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.02 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.02 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  36.56 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  37.35 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.74 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.06 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  39.62 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.02 
 
 		 266 aa  153  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  40 
 
 		 261 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  37.22 
 
 		 281 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  38.46 
 
 		 281 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3860  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.75 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  37.22 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.84 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  35.61 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  37.18 
 
 		 302 aa  148  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.89 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>