More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3761 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3761  Bacitracin resistance protein BacA  100 
 
 
295 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7544  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.79 
 
 
341 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.166412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0636  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.26 
 
 
277 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0787  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.26 
 
 
277 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0723  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.25 
 
 
282 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1299  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.13 
 
 
276 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.13 
 
 
297 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0736972  normal  0.172198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1204  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.57 
 
 
276 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1231  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.57 
 
 
276 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1301  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.72 
 
 
276 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581286  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1821  undecaprenyl-diphosphatase  37.15 
 
 
271 aa  176  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0020  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.67 
 
 
280 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.434672  normal  0.115672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4462  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.72 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.240669  normal  0.695003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.37 
 
 
276 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1319  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.37 
 
 
276 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0212  Undecaprenyl-diphosphatase  38.25 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.629944  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.86 
 
 
276 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2750  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.19 
 
 
276 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1713  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.19 
 
 
276 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.346313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1544  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.19 
 
 
276 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2837  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.13 
 
 
276 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0491533 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1513  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.85 
 
 
276 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.75 
 
 
282 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2402  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.97 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125714  normal  0.0217633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.52 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.52 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.93 
 
 
292 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  34.6 
 
 
281 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.99 
 
 
292 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.53 
 
 
276 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  34.01 
 
 
280 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.75 
 
 
276 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.39 
 
 
278 aa  148  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.75 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  32.53 
 
 
274 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.42 
 
 
280 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.34 
 
 
278 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.86 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.1 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  31.6 
 
 
264 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  32.98 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  34.52 
 
 
272 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  33.9 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.71 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  33.45 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  34.69 
 
 
273 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  33.1 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.34 
 
 
282 aa  132  9e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  32.19 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  33.79 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.1 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  31.1 
 
 
386 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  34.52 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  30 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.94 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.83 
 
 
320 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  30.56 
 
 
274 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.62 
 
 
265 aa  126  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.87 
 
 
266 aa  126  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.62 
 
 
282 aa  125  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.79 
 
 
265 aa  125  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  32.87 
 
 
279 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1174  bacitracin resistance protein BacA  34.81 
 
 
273 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  30.28 
 
 
302 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  34.4 
 
 
261 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  31.71 
 
 
262 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  29.93 
 
 
322 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  29.93 
 
 
322 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.27 
 
 
266 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.38 
 
 
266 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  32.09 
 
 
279 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.14 
 
 
282 aa  122  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1816  undecaprenol kinase, putative  29.27 
 
 
255 aa  122  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.08 
 
 
277 aa  122  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0466  bacitracin resistance protein BacA  27.62 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.13617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  34.4 
 
 
269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  31 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.52 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  31.4 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.77 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04545  putative undecaprenol kinase  31.76 
 
 
264 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0034  bacitracin resistance protein BacA  28.67 
 
 
237 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.530544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.1 
 
 
266 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0766  undecaprenyl-diphosphatase  34.29 
 
 
276 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0034  bacitracin resistance protein BacA  28.67 
 
 
237 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000586999  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  31.25 
 
 
281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  28.37 
 
 
255 aa  119  6e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0848  undecaprenol kinase  31.47 
 
 
307 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.433403  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1197  bacitracin resistance protein BacA  28.67 
 
 
247 aa  119  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.23 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1209  undecaprenol kinase  34.33 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0163  putative undecaprenol kinase  33.33 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.714151  normal  0.0225352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  31.1 
 
 
273 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0524  undecaprenol kinase  32.87 
 
 
272 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  31.56 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  30.98 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.56 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0196  Bacitracin resistance protein BacA  28.42 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.03 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>