More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0490 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2501  heavy metal translocating P-type ATPase  53.17 
 
 
810 aa  713  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.792891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1679  heavy metal translocating P-type ATPase  61.21 
 
 
810 aa  797  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238517  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0781  heavy metal translocating P-type ATPase  59.67 
 
 
773 aa  794  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114633  decreased coverage  0.000689318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  59.24 
 
 
737 aa  763  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0090  heavy metal translocating P-type ATPase  67.14 
 
 
764 aa  741  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  61.11 
 
 
867 aa  853  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36160  copper/silver-translocating P-type ATPase  53.87 
 
 
847 aa  721  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735078  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2244  heavy metal translocating P-type ATPase  59.17 
 
 
737 aa  765  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  59.64 
 
 
757 aa  879  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.66102  normal  0.575194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5747  heavy metal translocating P-type ATPase  60.09 
 
 
792 aa  833  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0020  heavy metal-transporting ATPase  62.04 
 
 
746 aa  887  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.668167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3699  heavy metal-transporting ATPase  62.05 
 
 
745 aa  847  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0922687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6798  heavy metal translocating P-type ATPase  58.7 
 
 
739 aa  740  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4546  heavy metal translocating P-type ATPase  57.68 
 
 
750 aa  785  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3962  heavy metal translocating P-type ATPase  63.98 
 
 
737 aa  744  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0396951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4550  heavy metal translocating P-type ATPase  59.16 
 
 
761 aa  860  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19800  copper/silver-translocating P-type ATPase  58.85 
 
 
768 aa  767  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.139092  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10590  copper/silver-translocating P-type ATPase  59.64 
 
 
755 aa  849  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.524998 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  60.85 
 
 
760 aa  830  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.879703  decreased coverage  0.00498444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36740  copper/silver-translocating P-type ATPase  61.92 
 
 
769 aa  845  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.289681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  59.43 
 
 
766 aa  867  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0490  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
850 aa  1634  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.888341  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  56.67 
 
 
785 aa  775  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8844  heavy metal translocating P-type ATPase  58.64 
 
 
764 aa  793  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4240  heavy metal translocating P-type ATPase  57.14 
 
 
785 aa  777  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21370  copper/silver-translocating P-type ATPase  48.69 
 
 
819 aa  650  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.770676  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  56.89 
 
 
758 aa  754  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3788  heavy metal translocating P-type ATPase  58.43 
 
 
785 aa  780  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0448  heavy metal translocating P-type ATPase  66.34 
 
 
763 aa  747  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189205  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  56.31 
 
 
868 aa  727  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0136412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  60.55 
 
 
769 aa  845  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4099  heavy metal translocating P-type ATPase  52.96 
 
 
779 aa  699  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1901  heavy metal translocating P-type ATPase  58.08 
 
 
749 aa  797  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0013  heavy metal translocating P-type ATPase  60.76 
 
 
745 aa  820  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  60.86 
 
 
762 aa  821  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  61.58 
 
 
795 aa  792  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5704  heavy metal translocating P-type ATPase  58.75 
 
 
782 aa  823  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.563796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1470  heavy metal translocating P-type ATPase  58.76 
 
 
760 aa  825  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  58.51 
 
 
782 aa  822  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0968777  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5305  heavy metal translocating P-type ATPase  58.75 
 
 
782 aa  823  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.585321  normal  0.36068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6538  heavy metal translocating P-type ATPase  62.38 
 
 
785 aa  798  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451318  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4018  heavy metal translocating P-type ATPase  64.77 
 
 
777 aa  754  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3605  heavy metal translocating P-type ATPase  66.52 
 
 
765 aa  784  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312774  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2848  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  63.85 
 
 
752 aa  822  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4022  heavy metal translocating P-type ATPase  63.98 
 
 
737 aa  744  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217745  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1452  heavy metal translocating P-type ATPase  58.76 
 
 
760 aa  825  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3948  heavy metal translocating P-type ATPase  63.98 
 
 
737 aa  744  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5837  heavy metal translocating P-type ATPase  58.61 
 
 
733 aa  820  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0536  heavy metal translocating P-type ATPase  61.36 
 
 
764 aa  780  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188836  normal  0.0794142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3873  heavy metal translocating P-type ATPase  54.1 
 
 
770 aa  631  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00658121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2769  heavy metal translocating P-type ATPase  48.04 
 
 
739 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0304144  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10093  cation transporter ATPase A ctpA  45.84 
 
 
761 aa  579  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0081  heavy metal translocating P-type ATPase  48.8 
 
 
751 aa  582  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.768822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  39.91 
 
 
798 aa  569  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  38.94 
 
 
815 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.16614e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
802 aa  563  1e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
802 aa  563  1e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  39.11 
 
 
743 aa  563  1e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  39.34 
 
 
805 aa  557  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  39.93 
 
 
797 aa  558  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.86 
 
 
794 aa  558  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  50.52 
 
 
792 aa  555  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2618  heavy metal translocating P-type ATPase  43.73 
 
 
754 aa  555  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  40.37 
 
 
753 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
803 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  38.14 
 
 
796 aa  540  1e-152  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  40.11 
 
 
821 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  39.2 
 
 
805 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  39.2 
 
 
805 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97644e-14 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  39.08 
 
 
805 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  39.1 
 
 
805 aa  533  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.16421e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  39.24 
 
 
806 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  3.37327e-05 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  39.08 
 
 
805 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  4.48263e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  39.22 
 
 
806 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  39.58 
 
 
805 aa  535  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.81926e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  40.27 
 
 
799 aa  529  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  41.21 
 
 
786 aa  531  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  39.46 
 
 
806 aa  529  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  40.94 
 
 
837 aa  527  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  41.77 
 
 
836 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  40.21 
 
 
752 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  39.15 
 
 
750 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  37.6 
 
 
759 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  37.6 
 
 
759 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  41.23 
 
 
817 aa  519  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  38.52 
 
 
798 aa  522  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  38.52 
 
 
798 aa  522  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  45.64 
 
 
824 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10104  cation transporter ATPase B ctpB  49.06 
 
 
752 aa  517  1e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  41.46 
 
 
831 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  42.09 
 
 
849 aa  516  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  36.19 
 
 
797 aa  514  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  37.57 
 
 
817 aa  515  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  39.15 
 
 
759 aa  514  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  42.23 
 
 
792 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  41.53 
 
 
837 aa  506  1e-142  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  35.87 
 
 
818 aa  506  1e-142  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  40.73 
 
 
826 aa  509  1e-142  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  41.16 
 
 
814 aa  508  1e-142  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  39.16 
 
 
835 aa  504  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>