More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1142 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  100 
 
 		 155 aa  314  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  73.55 
 
 		 155 aa  254  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  73.55 
 
 		 155 aa  254  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  74.19 
 
 		 155 aa  250  4.0000000000000004e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0794  30S ribosomal protein S7  62.58 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  62.99 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  209  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  206  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  63.27 
 
 		 156 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  62.16 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1659  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.13751  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 155 aa  199  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 		 155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 155 aa  196  9e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  58.6 
 
 		 159 aa  196  9e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  196  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  60.54 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000269779  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1832  ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000136289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 155 aa  194  3e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0452  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  59.18 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  56.46 
 
 		 156 aa  193  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  56.46 
 
 		 156 aa  193  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  56.46 
 
 		 156 aa  193  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  193  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  193  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  193  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000044788  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  56.49 
 
 		 156 aa  193  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000189839  hitchhiker  0.0000425179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 157 aa  193  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  193  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1312  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342852  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0541  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0512  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.083045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1443  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  56.55 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  191  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 		 158 aa  190  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  190  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0959  ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000015006  hitchhiker  0.000000000143074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  189  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  189  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10050  SSU ribosomal protein S7P  53.9 
 
 		 156 aa  189  9e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000294086  hitchhiker  0.00000000101858 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  55.78 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0558  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0854  30S ribosomal protein S7  54.79 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.633412  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  57.82 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  56.58 
 
 		 157 aa  188  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  59.86 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  57.82 
 
 		 156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0722  30S ribosomal protein S7  56.77 
 
 		 157 aa  187  4e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0592773  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  56.46 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  56.46 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4030  30S ribosomal protein S7  56.58 
 
 		 157 aa  187  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00016253  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  60.56 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1188  ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  186  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000113483  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  53.85 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000114638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>