192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0262 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0262  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 568 aa  1173    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.282617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0582  radical SAM domain-containing protein  61.86 
 
 		 567 aa  738    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1506  radical SAM domain-containing protein  59.79 
 
 		 554 aa  669    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0596  radical SAM domain-containing protein  61.86 
 
 		 567 aa  738    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.578273  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1417  Fe-S oxidoreductase, radical SAM domain protein  48.75 
 
 		 583 aa  547  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1094  hypothetical protein  47.16 
 
 		 639 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0145194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0407  radical SAM domain-containing protein  48.58 
 
 		 595 aa  529  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1109  Radical SAM domain protein  47.71 
 
 		 571 aa  531  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.890323  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1407  hypothetical protein  48.15 
 
 		 662 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00374356  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1216  hypothetical protein  47.8 
 
 		 662 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0609  radical SAM family protein  47.42 
 
 		 603 aa  519  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00147953  hitchhiker  0.00191958 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1776  hypothetical protein  46.79 
 
 		 622 aa  518  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0915  Radical SAM domain protein  46.13 
 
 		 599 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3346  Radical SAM domain protein  46.21 
 
 		 598 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0576598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0603  hypothetical protein  46.19 
 
 		 683 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3126  hypothetical protein  45.01 
 
 		 642 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0311249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2132  hypothetical protein  45.53 
 
 		 620 aa  506  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3616  hypothetical protein  44.48 
 
 		 685 aa  504  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2444  radical SAM domain-containing protein  46.52 
 
 		 640 aa  499  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11120  Fe-S oxidoreductase  43.96 
 
 		 718 aa  501  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390145  normal  0.0549005 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1538  radical SAM domain-containing protein  48.08 
 
 		 598 aa  500  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.415289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0556  radical SAM domain-containing protein  44.7 
 
 		 623 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.837617  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1858  radical SAM domain-containing protein  46.35 
 
 		 600 aa  498  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0281  Radical SAM domain protein  48.26 
 
 		 589 aa  497  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3187  Radical SAM domain protein  45.66 
 
 		 607 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00436822  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0066  radical SAM family protein  43.03 
 
 		 648 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0068  radical SAM domain-containing protein  43.72 
 
 		 658 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.514908  normal  0.0285773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1052  radical SAM domain-containing protein  45.42 
 
 		 605 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.173598  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2873  radical SAM domain-containing protein  45.95 
 
 		 605 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0072  Radical SAM domain protein  43.37 
 
 		 648 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2328  Radical SAM domain protein  43.67 
 
 		 666 aa  484  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6215  radical SAM domain-containing protein  44.23 
 
 		 679 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.310596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1897  Fe-S oxidoreductase  43.63 
 
 		 625 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0689  radical SAM family protein  42.39 
 
 		 671 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4193  Radical SAM domain protein  43.08 
 
 		 678 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0084  Radical SAM domain protein  43.03 
 
 		 648 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.028481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7218  hypothetical protein  42.39 
 
 		 674 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1972  Radical SAM domain protein  42.91 
 
 		 621 aa  474  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270598  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0293  hypothetical protein  41.19 
 
 		 710 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5075  Radical SAM domain protein  43.52 
 
 		 688 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4610  radical SAM domain-containing protein  42.74 
 
 		 688 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159872 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1103  radical SAM domain-containing protein  43.84 
 
 		 673 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0746  Radical SAM domain protein  42.45 
 
 		 677 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0942  radical SAM domain-containing protein  43.16 
 
 		 679 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1515  Radical SAM domain protein  39.11 
 
 		 758 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0572332  hitchhiker  0.00245581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02888  hypothetical protein  40.23 
 
 		 739 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2297  Elongator protein 3/MiaB/NifB  44.93 
 
 		 620 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1632  extracellular solute-binding protein  43.63 
 
 		 612 aa  456  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02838  hypothetical protein  40.23 
 
 		 739 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1364  radical SAM domain-containing protein  39.49 
 
 		 755 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0684  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 		 739 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07700  hypothetical protein  38.62 
 
 		 757 aa  455  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.568115  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3194  hypothetical protein  40.06 
 
 		 739 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3424  hypothetical protein  39.9 
 
 		 723 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4327  hypothetical protein  40.06 
 
 		 739 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3349  hypothetical protein  39.9 
 
 		 723 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3352  hypothetical protein  39.9 
 
 		 723 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3300  hypothetical protein  40.06 
 
 		 739 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0672097 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0681  hypothetical protein  40.06 
 
 		 739 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3418  hypothetical protein  39.9 
 
 		 723 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3451  hypothetical protein  40.06 
 
 		 739 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3519  hypothetical protein  39.9 
 
 		 723 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3484  hypothetical protein  40.06 
 
 		 739 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1359  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.21 
 
 		 646 aa  452  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1013  Radical SAM domain protein  42.23 
 
 		 607 aa  449  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000409081  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1663  Radical SAM domain protein  38.55 
 
 		 745 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4234  hypothetical protein  38.91 
 
 		 721 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.577109 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3424  hypothetical protein  39.9 
 
 		 724 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0652  hypothetical protein  38.24 
 
 		 763 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000231874 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4160  hypothetical protein  40.24 
 
 		 687 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2003  radical SAM family protein  40.53 
 
 		 707 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0666  hypothetical protein  38.96 
 
 		 775 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0585  hypothetical protein  38.96 
 
 		 787 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1409  Radical SAM domain protein  41.62 
 
 		 614 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0311  hypothetical protein  38.69 
 
 		 786 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3981  hypothetical protein  38.86 
 
 		 812 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4177  hypothetical protein  38.86 
 
 		 807 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3670  hypothetical protein  38.53 
 
 		 781 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0275  hypothetical protein  38.53 
 
 		 781 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3874  hypothetical protein  38.53 
 
 		 781 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0959799 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0856  hypothetical protein  38.91 
 
 		 790 aa  434  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.109884  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01783  hypothetical protein  38.23 
 
 		 791 aa  432  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4090  hypothetical protein  38.86 
 
 		 816 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4059  hypothetical protein  38.86 
 
 		 819 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3682  hypothetical protein  38.69 
 
 		 790 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1403  Radical SAM domain protein  39.3 
 
 		 630 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.59751 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2153  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.78 
 
 		 763 aa  431  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0540  hypothetical protein  38.72 
 
 		 767 aa  430  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212733  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0396  hypothetical protein  39.8 
 
 		 773 aa  432  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2271  radical SAM domain-containing protein  38.14 
 
 		 770 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3349  hypothetical protein  38.74 
 
 		 806 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1188  Radical SAM domain protein  40.07 
 
 		 740 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0934  hypothetical protein  39.52 
 
 		 634 aa  425  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.157188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0279  hypothetical protein  38.36 
 
 		 777 aa  425  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3439  hypothetical protein  38.19 
 
 		 785 aa  425  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0819  radical SAM domain-containing protein  41.52 
 
 		 680 aa  425  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02777  hypothetical protein  37.58 
 
 		 787 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4218  hypothetical protein  37.38 
 
 		 774 aa  421  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0382  hypothetical protein  37.54 
 
 		 763 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1314  hypothetical protein  38.29 
 
 		 789 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>