More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2878 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2878  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
391 aa  818    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1021  putative acyl-CoA dehydrogenase  61.28 
 
 
383 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4600  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.92 
 
 
380 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01664  predicted acyl-CoA dehydrogenase  50.64 
 
 
383 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1947  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.64 
 
 
383 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0267578  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.64 
 
 
383 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2411  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.64 
 
 
383 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1487  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.92 
 
 
383 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971669 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1468  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.92 
 
 
383 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.283366  normal  0.0792636 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1987  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.92 
 
 
383 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143395  hitchhiker  0.00158428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1898  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.64 
 
 
383 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1936  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.64 
 
 
383 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0137614 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1501  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.64 
 
 
384 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1816  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.92 
 
 
383 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.297013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1452  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.92 
 
 
383 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.215854  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01653  hypothetical protein  50.64 
 
 
383 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1911  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.64 
 
 
383 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1388  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.51 
 
 
383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.977333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1403  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.92 
 
 
381 aa  378  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4037  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  43.08 
 
 
378 aa  328  8e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2675  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  42.31 
 
 
378 aa  319  5e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0570  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  43.59 
 
 
377 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.741044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00043  crotonobetaine reductase subunit II, FAD-binding  42.71 
 
 
380 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3560  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.71 
 
 
380 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  42.71 
 
 
380 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00042  hypothetical protein  42.71 
 
 
380 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0041  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  42.71 
 
 
380 aa  317  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3616  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  42.71 
 
 
380 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0669979 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  42.71 
 
 
380 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0040  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  42.71 
 
 
380 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1834  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  42.53 
 
 
383 aa  315  7e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0080  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  42.2 
 
 
380 aa  312  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0079  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  42.2 
 
 
380 aa  312  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0999313  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  42.2 
 
 
380 aa  312  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  42.2 
 
 
380 aa  312  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0081  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  42.2 
 
 
380 aa  312  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124381  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3228  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  40.77 
 
 
378 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09220  acyl-CoA dehydrogenase  42.6 
 
 
385 aa  311  1e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605884  normal  0.299074 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08800  acyl-CoA dehydrogenase  42.86 
 
 
384 aa  299  7e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.320154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0310  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.52 
 
 
383 aa  295  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1840  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.46 
 
 
384 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0618853  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1861  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.62 
 
 
394 aa  268  8.999999999999999e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.128157  normal  0.323931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.29 
 
 
385 aa  253  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.509328  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3756  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.51 
 
 
404 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3744  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.51 
 
 
404 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3817  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.51 
 
 
404 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.420794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 
396 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4210  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.67 
 
 
399 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0538412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2442  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.37 
 
 
395 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.830058  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1150  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.25 
 
 
380 aa  194  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.39 
 
 
377 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08750  acyl-CoA dehydrogenase  31.16 
 
 
386 aa  192  7e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.456879  normal  0.674074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.11 
 
 
380 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2429  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.94 
 
 
382 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62219  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.39 
 
 
385 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0626  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.53 
 
 
386 aa  186  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000265202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3267  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.11 
 
 
379 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.691288  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4519  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  28.46 
 
 
388 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.56 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.58 
 
 
394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.334789  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  31.96 
 
 
376 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  31.96 
 
 
376 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  31.96 
 
 
376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  31.96 
 
 
376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  31.96 
 
 
376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  31.96 
 
 
381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  31.96 
 
 
376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.59 
 
 
380 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.77 
 
 
381 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.44 
 
 
376 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.99 
 
 
380 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.72 
 
 
388 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.11 
 
 
379 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.39 
 
 
376 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4816  Acyl-CoA dehydrogenase  29.24 
 
 
388 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  31.7 
 
 
381 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1284  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.01 
 
 
388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1586  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.98 
 
 
388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698291  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1641  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.83 
 
 
388 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.426767  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1188  acyl-CoA dehydrogenase-like  28.83 
 
 
388 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1668  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.83 
 
 
388 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0975176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.9 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.61 
 
 
381 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4458  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.08 
 
 
390 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000540968  normal  0.0304373 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0247  Acyl-CoA dehydrogenase  30.96 
 
 
378 aa  179  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2198  acyl-CoA dehydrogenase-like  29.28 
 
 
379 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.583783 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.01 
 
 
381 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  31.19 
 
 
381 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.33 
 
 
400 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.26 
 
 
382 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1849  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.56 
 
 
382 aa  178  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03805  acyl-CoA dehydrogenase  30.75 
 
 
387 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  31.11 
 
 
380 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0812  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  31.71 
 
 
393 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0539  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.66 
 
 
405 aa  177  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00283131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44590  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.85 
 
 
382 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09270  acyl-CoA dehydrogenase  32.23 
 
 
388 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2640  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.59 
 
 
382 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.08 
 
 
379 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  30.36 
 
 
381 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>