36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2877 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  100 
 
 		 265 aa  550  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  63.57 
 
 		 259 aa  332  5e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  51.32 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  34.39 
 
 		 270 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  34.39 
 
 		 264 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  33.07 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  34 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  32.94 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  31.84 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  32.94 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  32.94 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  32.82 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  30.62 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  30.62 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  30.62 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  30.95 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  29.62 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  29.41 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  32.54 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  30.23 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  28.46 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  30.5 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  30.97 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  30.58 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  30.36 
 
 		 332 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  29.09 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  31.6 
 
 		 266 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  28.57 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  28.95 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  30.4 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  30 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  28.41 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  27.67 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  28.48 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  24.63 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0057  hypothetical protein  32.35 
 
 		 228 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>