89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4786 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4786  H-NS histone family protein  100 
 
 		 146 aa  297  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.428354 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4700  DNA-binding protein  60.96 
 
 		 144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3387  DNA-binding protein H-NS-like protein  60.27 
 
 		 144 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01827  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  58.97 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1351  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.77 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0110439  hitchhiker  0.00767889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1404  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.25 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773951  normal  0.9865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2585  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.17 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000212728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2856  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.24 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2913  DNA binding protein, nucleoid-associated  39.39 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2980  DNA binding protein, nucleoid-associated  39.39 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.681217  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2945  DNA binding protein, nucleoid-associated  39.39 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.14201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2997  DNA binding protein, nucleoid-associated  39.39 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.0364479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3102  DNA binding protein, nucleoid-associated  39.39 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal  0.844597 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1957  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.37 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1416  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.25 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00233677  normal  0.422691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3146  H-NS family DNA-binding protein  32.88 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00994  DNA-binding protein, H-NS family  32.5 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.67 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112117  normal  0.570223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2512  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.88 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00123836  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2749  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  24.79 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000604606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3237  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  27.42 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.602482 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003852  DNA-binding protein H-NS  31.11 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0195644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1444  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  26.72 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.292783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2199  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.31 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.927569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1981  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  37.31 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.295466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2848  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.88 
 
 		 130 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000899352  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2867  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.88 
 
 		 130 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00308675  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1510  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.88 
 
 		 130 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000161891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2996  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.88 
 
 		 130 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.18601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0123  DNA-binding protein H-NS  31.76 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.577813  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.74 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3149  DNA binding protein, nucleoid-associated  40.28 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000112797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2329  H-NS histone family protein  27.56 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1305  hitchhiker  0.00000000912792 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3212  DNA binding protein, nucleoid-associated  35.21 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3911  DNA binding protein, nucleoid-associated  35.21 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.268261 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02489  hypothetical protein  35.21 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2789  DNA binding protein, nucleoid-associated  35.21 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1037  DNA binding protein, nucleoid-associated  35.21 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2949  DNA binding protein, nucleoid-associated  35.21 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02525  DNA binding protein, nucleoid-associated  35.21 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1014  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.21 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2282  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  34.33 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2804  DNA binding protein, nucleoid-associated  33.8 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2074  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  55 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.944345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2706  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  55 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  hitchhiker  0.000198201 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1966  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  55 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.695002  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2167  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  55 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.317545  normal  0.0612895 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.9 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1345  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  38.37 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000969162  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01213  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  38.37 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.982069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1386  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  38.37 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.44738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2412  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.37 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00877695  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01223  hypothetical protein  38.37 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  38.16 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1722  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  38.37 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.344605  normal  0.876204 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1904  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  38.37 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300661  normal  0.199286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2390  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  38.37 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393969  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1402  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  38.37 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.844413  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1168  H-NS family DNA-binding protein  45.95 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.827071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3349  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.9 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2605  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.82 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.730726  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0306  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  50 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.265101  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  28.33 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0700  DNA-binding protein VicH  27.41 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1957  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  28.71 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00140882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2145  DNA binding protein, global metabolism regulator  23.48 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0787  DNA-binding protein H-NS  31.43 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.123185  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  29.13 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.01 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1152  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.25 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2575  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.25 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  30.63 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2306  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  52.5 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.283331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2540  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000233995  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0519  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000291454  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2842  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.72 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00137778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1878  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  42.55 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1577  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  42.55 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.09 
 
 		 102 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1394  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  42.55 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00484483  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0005  DNA-binding protein H-NS family  38.24 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000922105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1884  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  42.55 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.276243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1941  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  42.55 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118204  normal  0.862978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3053  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.72 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0965485  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1754  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.15 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.63 
 
 		 100 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>