92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2842 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2842  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 		 133 aa  263  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00137778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3053  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  90.98 
 
 		 133 aa  244  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0965485  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2575  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  84.96 
 
 		 133 aa  229  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1152  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  84.96 
 
 		 133 aa  229  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1754  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  89.47 
 
 		 133 aa  226  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2329  H-NS histone family protein  72.39 
 
 		 134 aa  197  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1305  hitchhiker  0.00000000912792 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2605  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  73.68 
 
 		 132 aa  180  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.730726  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1957  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  63.91 
 
 		 135 aa  156  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1981  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  61.65 
 
 		 135 aa  153  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.295466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2199  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  62.41 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.927569  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2282  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  59.4 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2306  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  64.44 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.283331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1394  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  64.44 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00484483  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1577  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  64.44 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1878  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  64.44 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1884  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  64.44 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.276243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1941  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  64.44 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118204  normal  0.862978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2706  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  61.65 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  hitchhiker  0.000198201 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1722  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  62.96 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.344605  normal  0.876204 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1904  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  62.96 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300661  normal  0.199286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01223  hypothetical protein  62.96 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1402  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  62.96 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.844413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2390  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  62.96 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393969  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1386  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  62.96 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.44738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2412  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  62.96 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00877695  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1345  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  62.96 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000969162  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01213  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  62.96 
 
 		 137 aa  140  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.982069  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2167  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  61.65 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.317545  normal  0.0612895 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1966  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  61.65 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.695002  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2074  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  61.65 
 
 		 135 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.944345  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0306  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  53.73 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.265101  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01827  hypothetical protein  51.11 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2997  DNA binding protein, nucleoid-associated  54.14 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.0364479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2980  DNA binding protein, nucleoid-associated  54.14 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.681217  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2945  DNA binding protein, nucleoid-associated  54.14 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.14201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2913  DNA binding protein, nucleoid-associated  54.14 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3102  DNA binding protein, nucleoid-associated  54.14 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal  0.844597 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3212  DNA binding protein, nucleoid-associated  55.97 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2789  DNA binding protein, nucleoid-associated  55.97 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3911  DNA binding protein, nucleoid-associated  55.97 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.268261 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02489  hypothetical protein  55.97 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1037  DNA binding protein, nucleoid-associated  55.97 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02525  DNA binding protein, nucleoid-associated  55.97 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1014  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  55.97 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2949  DNA binding protein, nucleoid-associated  55.97 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2804  DNA binding protein, nucleoid-associated  56.06 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3149  DNA binding protein, nucleoid-associated  53.73 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000112797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2145  DNA binding protein, global metabolism regulator  52.94 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0700  DNA-binding protein VicH  52.59 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003852  DNA-binding protein H-NS  51.85 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0195644  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0787  DNA-binding protein H-NS  43.8 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.123185  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0123  DNA-binding protein H-NS  44.2 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.577813  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  42.31 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2749  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.35 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000604606  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2856  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.84 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3237  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.09 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.602482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1444  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.34 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.292783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2540  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  39.1 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000233995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1351  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.84 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0110439  hitchhiker  0.00767889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2148  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.35 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00994  DNA-binding protein, H-NS family  36.84 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.59 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112117  normal  0.570223 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2585  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.09 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000212728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3146  H-NS family DNA-binding protein  35.34 
 
 		 130 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2512  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.59 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00123836  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1510  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.84 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000161891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2996  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.84 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.18601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2867  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.84 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00308675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2848  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.84 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000899352  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1416  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.09 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00233677  normal  0.422691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1404  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.09 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773951  normal  0.9865 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0005  DNA-binding protein H-NS family  37.88 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000922105  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3387  DNA-binding protein H-NS-like protein  33.07 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1168  H-NS family DNA-binding protein  39.85 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.827071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4700  DNA-binding protein  33.07 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0122  DNA binding protein  33.33 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.73 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.97 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.61 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.3 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2010  H-NS histone family protein  37.11 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0227527  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.3 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2782  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.66 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0983316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0766  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.11 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.31 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4786  H-NS histone family protein  48.72 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.428354 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.22 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.05 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5155  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.82 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336859  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0416  nucleoid protein H-NS  33.87 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0193878  hitchhiker  0.00866736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.82 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386763  normal  0.64236 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.65 
 
 		 105 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>