86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1878 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1577  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  100 
 
 		 137 aa  274  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.102645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1394  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  100 
 
 		 137 aa  274  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00484483  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1884  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  100 
 
 		 137 aa  274  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.276243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1941  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  100 
 
 		 137 aa  274  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.118204  normal  0.862978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1878  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  100 
 
 		 137 aa  274  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2199  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  85.93 
 
 		 135 aa  235  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.927569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1957  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  84.44 
 
 		 135 aa  233  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1981  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  82.96 
 
 		 135 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.295466  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1402  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  94.89 
 
 		 137 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.844413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1722  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  94.89 
 
 		 137 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.344605  normal  0.876204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2306  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  94.16 
 
 		 137 aa  231  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.283331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01223  hypothetical protein  94.89 
 
 		 137 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1904  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  94.89 
 
 		 137 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300661  normal  0.199286 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1345  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  94.89 
 
 		 137 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000969162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2390  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  94.89 
 
 		 137 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393969  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2412  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  94.89 
 
 		 137 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00877695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1386  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  94.89 
 
 		 137 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.44738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01213  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  94.89 
 
 		 137 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.982069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2282  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  81.48 
 
 		 135 aa  227  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2706  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  87.41 
 
 		 135 aa  220  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  hitchhiker  0.000198201 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2167  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  86.67 
 
 		 135 aa  215  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.317545  normal  0.0612895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2074  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  86.67 
 
 		 135 aa  215  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.944345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1966  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  86.67 
 
 		 135 aa  215  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.695002  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0306  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  70.59 
 
 		 136 aa  204  3e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.265101  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2329  H-NS histone family protein  62.96 
 
 		 134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1305  hitchhiker  0.00000000912792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3053  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  64.44 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0965485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2842  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  64.44 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00137778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1152  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  60.74 
 
 		 133 aa  155  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2575  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  60.74 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1754  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  65.19 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2605  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  61.48 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.730726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02525  DNA binding protein, nucleoid-associated  57.04 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1037  DNA binding protein, nucleoid-associated  57.04 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2789  DNA binding protein, nucleoid-associated  57.04 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3212  DNA binding protein, nucleoid-associated  57.04 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02489  hypothetical protein  57.04 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3911  DNA binding protein, nucleoid-associated  57.04 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.268261 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1014  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  57.04 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2949  DNA binding protein, nucleoid-associated  57.04 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2804  DNA binding protein, nucleoid-associated  56.3 
 
 		 134 aa  133  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01827  hypothetical protein  53.68 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3102  DNA binding protein, nucleoid-associated  52.59 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal  0.844597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2913  DNA binding protein, nucleoid-associated  52.59 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2945  DNA binding protein, nucleoid-associated  52.59 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.14201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2980  DNA binding protein, nucleoid-associated  52.59 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.681217  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2997  DNA binding protein, nucleoid-associated  52.59 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.0364479 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0700  DNA-binding protein VicH  54.48 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2145  DNA binding protein, global metabolism regulator  50.83 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3149  DNA binding protein, nucleoid-associated  48.89 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000112797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003852  DNA-binding protein H-NS  53.68 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0195644  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0123  DNA-binding protein H-NS  44.6 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.577813  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0787  DNA-binding protein H-NS  38.52 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.123185  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3237  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.22 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.602482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1444  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.48 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.292783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2585  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.48 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000212728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  41.67 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2856  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.78 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0005  DNA-binding protein H-NS family  46.21 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000922105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1351  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.3 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0110439  hitchhiker  0.00767889 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3146  H-NS family DNA-binding protein  35.56 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1404  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.56 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773951  normal  0.9865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1416  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.07 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00233677  normal  0.422691 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2540  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  41.48 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000233995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2749  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.56 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000604606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1510  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.56 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000161891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2848  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.56 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000899352  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2996  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.56 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.18601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2867  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.56 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00308675  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2512  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.25 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00123836  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2148  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00994  DNA-binding protein, H-NS family  36.5 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000272824  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.07 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112117  normal  0.570223 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1168  H-NS family DNA-binding protein  37.78 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.827071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0122  DNA binding protein  32.03 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4700  DNA-binding protein  25.95 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3387  DNA-binding protein H-NS-like protein  25.95 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  28.7 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  27.43 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.18 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  49.02 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  55.32 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.18 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.28 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4786  H-NS histone family protein  42.55 
 
 		 146 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.428354 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4990  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.25 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0212879  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.14 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>