More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1501 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1388  putative acyl-CoA dehydrogenase  92.17 
 
 
383 aa  759  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.977333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1468  putative acyl-CoA dehydrogenase  95.3 
 
 
383 aa  772  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.283366  normal  0.0792636 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1452  putative acyl-CoA dehydrogenase  95.3 
 
 
383 aa  772  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.215854  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1816  putative acyl-CoA dehydrogenase  95.3 
 
 
383 aa  772  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.297013  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1987  putative acyl-CoA dehydrogenase  95.04 
 
 
383 aa  771  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143395  hitchhiker  0.00158428 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1487  putative acyl-CoA dehydrogenase  95.3 
 
 
383 aa  772  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971669 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2411  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
383 aa  805  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1898  putative acyl-CoA dehydrogenase  99.74 
 
 
383 aa  802  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1936  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
383 aa  805  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0137614 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
383 aa  805  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01653  hypothetical protein  99.74 
 
 
383 aa  802  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1501  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
384 aa  807  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1911  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
383 aa  805  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1947  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
383 aa  805  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0267578  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01664  predicted acyl-CoA dehydrogenase  99.74 
 
 
383 aa  802  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1403  putative acyl-CoA dehydrogenase  66.4 
 
 
381 aa  556  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4600  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.02 
 
 
380 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1021  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.55 
 
 
383 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2878  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.64 
 
 
391 aa  409  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0570  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  49.34 
 
 
377 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.741044  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0080  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  48.43 
 
 
380 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.91 
 
 
380 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3616  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.91 
 
 
380 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0669979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0079  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  48.43 
 
 
380 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0999313  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0081  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  48.43 
 
 
380 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124381  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.91 
 
 
380 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00042  hypothetical protein  47.91 
 
 
380 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0041  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.91 
 
 
380 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00043  crotonobetaine reductase subunit II, FAD-binding  47.91 
 
 
380 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  48.43 
 
 
380 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0040  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.91 
 
 
380 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  48.43 
 
 
380 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3560  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.91 
 
 
380 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3228  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  46.72 
 
 
378 aa  357  2e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4037  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.38 
 
 
378 aa  354  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2675  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  46.19 
 
 
378 aa  350  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09220  acyl-CoA dehydrogenase  44.16 
 
 
385 aa  337  2e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605884  normal  0.299074 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1834  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  42.89 
 
 
383 aa  317  3e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1840  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.49 
 
 
384 aa  311  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0618853  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08800  acyl-CoA dehydrogenase  43.19 
 
 
384 aa  311  2e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.320154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0310  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.77 
 
 
383 aa  303  3e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.93 
 
 
385 aa  300  3e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.509328  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1861  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.8 
 
 
394 aa  270  3e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.128157  normal  0.323931 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1436  butyryl-CoA dehydrogenase  35.95 
 
 
410 aa  213  3e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.170652  hitchhiker  0.00553945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.05 
 
 
383 aa  213  5e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4210  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.99 
 
 
399 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0538412  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.55 
 
 
396 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2442  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.23 
 
 
395 aa  209  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.830058  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.47 
 
 
379 aa  209  9e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.95 
 
 
380 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0456  butyryl-CoA dehydrogenase  34.61 
 
 
410 aa  205  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.42 
 
 
376 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  34.37 
 
 
392 aa  204  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.02 
 
 
383 aa  203  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.68 
 
 
380 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0668  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.16 
 
 
379 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1608  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.82 
 
 
388 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3817  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.73 
 
 
404 aa  201  1e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.420794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3756  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.73 
 
 
404 aa  201  1e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3744  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  32.73 
 
 
404 aa  201  1e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0838  butyryl-CoA dehydrogenase  34.61 
 
 
410 aa  200  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09270  acyl-CoA dehydrogenase  34.39 
 
 
388 aa  199  8e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.9 
 
 
394 aa  199  8e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
381 aa  199  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
376 aa  198  1e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2429  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.79 
 
 
382 aa  199  1e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62219  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5206  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  32.98 
 
 
387 aa  198  1e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
381 aa  198  1e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
381 aa  198  1e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
376 aa  197  2e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.89 
 
 
380 aa  197  2e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
376 aa  197  2e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29924e-10 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
376 aa  198  2e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
376 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
376 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2198  acyl-CoA dehydrogenase-like  33.62 
 
 
379 aa  197  4e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.583783 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2926  acyl-CoA dehydrogenase  32.77 
 
 
390 aa  196  4e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.532316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.64 
 
 
376 aa  196  4e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2771  acyl-CoA dehydrogenase  32.77 
 
 
390 aa  196  4e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1147  acyl-CoA dehydrogenase  32.77 
 
 
390 aa  196  4e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.73 
 
 
388 aa  197  4e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  9.54759e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.68 
 
 
400 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0488  butyryl-CoA dehydrogenase  33.85 
 
 
379 aa  195  9e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00678793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.55 
 
 
381 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.9 
 
 
379 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3267  Acyl-CoA dehydrogenase-like  33.05 
 
 
379 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.691288  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.07 
 
 
379 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0539  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.08 
 
 
405 aa  193  4e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00283131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  32.98 
 
 
379 aa  193  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  32.28 
 
 
381 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  32.28 
 
 
381 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  32.28 
 
 
381 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  32.28 
 
 
381 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  32.28 
 
 
381 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.14865e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  32.28 
 
 
381 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  32.28 
 
 
381 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  32.98 
 
 
380 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.59 
 
 
385 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1849  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.16 
 
 
382 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0626  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.88 
 
 
386 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  2.65202e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>