29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0678 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 499 aa  989    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3060  polysaccharide biosynthesis protein  68.18 
 
 		 489 aa  620  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  40.97 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  27.8 
 
 		 507 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 		 504 aa  125  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 499 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  23.86 
 
 		 511 aa  89  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 504 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 468 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 514 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  27.33 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2096  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 		 482 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0062  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 510 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0651262  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 488 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  23.51 
 
 		 539 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  22.11 
 
 		 506 aa  47.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5386  polysaccharide transport protein, putative  22.27 
 
 		 508 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 		 491 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 		 492 aa  44.3  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  29.74 
 
 		 438 aa  44.3  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  20.16 
 
 		 516 aa  43.5  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>