77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1477 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  100 
 
 
269 aa  535  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0393  PilT protein domain protein  62.63 
 
 
388 aa  257  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2488  PilT protein-like  63.4 
 
 
383 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.0444425 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00910  PilT protein domain protein  62.94 
 
 
364 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000274223  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0081  PilT protein domain protein  62.37 
 
 
364 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0085  PilT protein domain protein  62.37 
 
 
364 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0127482  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2427  PIN/TRAM domain-containing protein  60.31 
 
 
368 aa  248  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0079  PilT domain-containing protein  61.14 
 
 
370 aa  248  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0115  PilT protein domain protein  59.09 
 
 
257 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.673954  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2740  PIN/TRAM domain-containing protein  60.62 
 
 
368 aa  248  7e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0084  hypothetical protein  59.09 
 
 
369 aa  247  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0079  PilT domain-containing protein  61.14 
 
 
367 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0084  hypothetical protein  59.09 
 
 
369 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0105  hypothetical protein  60.62 
 
 
369 aa  247  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0080  hypothetical protein  59.09 
 
 
369 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0083  hypothetical protein  59.09 
 
 
369 aa  247  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0081  hypothetical protein  59.09 
 
 
369 aa  247  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5221  hypothetical protein  60.62 
 
 
367 aa  246  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00102382  unclonable  1.43587e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0838  PilT domain-containing protein  62.63 
 
 
367 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000323541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  59.28 
 
 
363 aa  245  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0165  PilT protein domain protein  51.36 
 
 
366 aa  244  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0185  PilT domain-containing protein  60.2 
 
 
371 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000117639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0189  PilT protein-like  60.82 
 
 
384 aa  239  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.919011  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1002  PilT protein domain protein  56.37 
 
 
377 aa  240  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000369877  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0174  PilT protein domain protein  58.97 
 
 
367 aa  234  7e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0260  PilT protein domain protein  60.41 
 
 
383 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000167901  normal  0.0149964 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0400  PilT protein domain protein  61 
 
 
369 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000234721  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1851  PilT protein domain protein  53.61 
 
 
359 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165199  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0186  PilT domain-containing protein  56.41 
 
 
380 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442376  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2362  pili retraction protein PilT  56.06 
 
 
366 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.36366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  55.84 
 
 
346 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2600  PilT protein domain protein  53.93 
 
 
360 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3506  PilT protein domain protein  53.93 
 
 
360 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  0.104798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4460  PilT protein domain protein  53.4 
 
 
360 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1195  PilT protein-like  54.08 
 
 
359 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2383  nucleotide binding protein, PINc  53.4 
 
 
383 aa  217  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4268  PilT protein domain-containing protein  52.36 
 
 
358 aa  216  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2222  PilT protein-like  51.83 
 
 
358 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1561  PilT protein domain protein  52.85 
 
 
357 aa  211  9e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0302  PilT domain-containing protein  48.57 
 
 
380 aa  207  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0341  PilT protein domain protein  54.5 
 
 
346 aa  202  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0095  PilT protein domain protein  58.02 
 
 
168 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33572e-62 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2358  integral membrane protein  52.04 
 
 
361 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3254  PilT protein domain protein  47.69 
 
 
366 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2018  PilT domain-containing protein  40.81 
 
 
364 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  46.73 
 
 
358 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1657  PilT domain-containing protein  43.1 
 
 
355 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145178  normal  0.591632 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13601  integral membrane protein  47.98 
 
 
371 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.729181  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1515  PilT protein domain protein  46.19 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1733  PilT domain-containing protein  43.08 
 
 
361 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.147599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0185  PilT domain-containing protein  38.89 
 
 
385 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000320699  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  44.9 
 
 
385 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2177  PilT protein domain protein  39.18 
 
 
344 aa  181  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1298  PilT protein domain protein  47.94 
 
 
346 aa  179  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  45.32 
 
 
357 aa  178  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  45.32 
 
 
357 aa  178  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2116  PilT domain-containing protein  37.89 
 
 
336 aa  178  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20011  integral membrane protein  44.28 
 
 
389 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192672 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1547  nucleotide binding protein, PINc  38.93 
 
 
388 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111102  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  42.29 
 
 
369 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0842  nucleotide binding protein, PINc  39.53 
 
 
385 aa  167  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.214431  normal  0.01039 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17331  integral membrane protein  42.64 
 
 
369 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.07903  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  41.79 
 
 
369 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  41.79 
 
 
369 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0878  PIN domain superfamily protein  42.64 
 
 
369 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.412243  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0998  PilT protein-like protein  41.88 
 
 
361 aa  165  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00567105  normal  0.0135719 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14731  integral membrane protein  41.79 
 
 
369 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.961128  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  29.21 
 
 
631 aa  53.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  31.69 
 
 
655 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1614  PilT domain-containing protein  30.7 
 
 
112 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  31.15 
 
 
634 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  26.19 
 
 
605 aa  43.5  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  26.21 
 
 
671 aa  43.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  26.52 
 
 
521 aa  43.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  27.48 
 
 
630 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  28.57 
 
 
602 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  31.16 
 
 
640 aa  42  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>