69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2427 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2427  PIN/TRAM domain-containing protein  100 
 
 
368 aa  727    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2740  PIN/TRAM domain-containing protein  99.46 
 
 
368 aa  724    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0838  PilT domain-containing protein  52.56 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000323541  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0085  PilT protein domain protein  48.78 
 
 
364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0127482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5221  hypothetical protein  50.67 
 
 
367 aa  332  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00102382  unclonable  1.43587e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0393  PilT protein domain protein  50.53 
 
 
388 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0081  PilT protein domain protein  47.44 
 
 
364 aa  328  7e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0079  PilT domain-containing protein  50 
 
 
367 aa  325  5e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0165  PilT protein domain protein  48.78 
 
 
366 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0084  hypothetical protein  49.46 
 
 
369 aa  323  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0084  hypothetical protein  49.46 
 
 
369 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0083  hypothetical protein  49.46 
 
 
369 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0081  hypothetical protein  49.46 
 
 
369 aa  323  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0080  hypothetical protein  49.46 
 
 
369 aa  323  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2488  PilT protein-like  48.51 
 
 
383 aa  322  5e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.0444425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0105  hypothetical protein  49.46 
 
 
369 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0079  PilT domain-containing protein  48.26 
 
 
370 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0186  PilT domain-containing protein  54.33 
 
 
380 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0260  PilT protein domain protein  52.16 
 
 
383 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000167901  normal  0.0149964 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  45.95 
 
 
363 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00910  PilT protein domain protein  48.66 
 
 
364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000274223  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0174  PilT protein domain protein  43.63 
 
 
367 aa  301  1e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0115  PilT protein domain protein  60.56 
 
 
257 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.673954  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0185  PilT domain-containing protein  50.17 
 
 
371 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000117639  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0302  PilT domain-containing protein  44.24 
 
 
380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0341  PilT protein domain protein  45.65 
 
 
346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220922  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0400  PilT protein domain protein  51.59 
 
 
369 aa  269  5e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000234721  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1002  PilT protein domain protein  37.63 
 
 
377 aa  256  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000369877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0189  PilT protein-like  61.31 
 
 
384 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.919011  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  46.1 
 
 
346 aa  252  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  60.31 
 
 
269 aa  248  9e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1561  PilT protein domain protein  39.32 
 
 
357 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4268  PilT protein domain-containing protein  46.55 
 
 
358 aa  245  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2222  PilT protein-like  44.97 
 
 
358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0095  PilT protein domain protein  72.84 
 
 
168 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33572e-62 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3506  PilT protein domain protein  57.36 
 
 
360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  0.104798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2600  PilT protein domain protein  57.36 
 
 
360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2362  pili retraction protein PilT  46.77 
 
 
366 aa  243  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.36366  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1851  PilT protein domain protein  43.25 
 
 
359 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165199  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4460  PilT protein domain protein  54.82 
 
 
360 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1195  PilT protein-like  44.77 
 
 
359 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  40.96 
 
 
358 aa  226  6e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2383  nucleotide binding protein, PINc  37.63 
 
 
383 aa  226  7e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694087 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2358  integral membrane protein  42.86 
 
 
361 aa  217  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  34.86 
 
 
357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  34.86 
 
 
357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1733  PilT domain-containing protein  35.6 
 
 
361 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.147599 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2018  PilT domain-containing protein  36.77 
 
 
364 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3254  PilT protein domain protein  36.46 
 
 
366 aa  205  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1515  PilT protein domain protein  48.28 
 
 
331 aa  199  7.999999999999999e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  33.24 
 
 
385 aa  195  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2116  PilT domain-containing protein  44.56 
 
 
336 aa  189  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17331  integral membrane protein  35.48 
 
 
369 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.07903  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0878  PIN domain superfamily protein  35.22 
 
 
369 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.412243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0185  PilT domain-containing protein  36.88 
 
 
385 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000320699  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1298  PilT protein domain protein  48.98 
 
 
346 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1657  PilT domain-containing protein  33.51 
 
 
355 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145178  normal  0.591632 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2177  PilT protein domain protein  38.1 
 
 
344 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20011  integral membrane protein  38.31 
 
 
389 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192672 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13601  integral membrane protein  44.44 
 
 
371 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.729181  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  42.93 
 
 
369 aa  175  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  31.86 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  42.42 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1547  nucleotide binding protein, PINc  36.02 
 
 
388 aa  170  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111102  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0842  nucleotide binding protein, PINc  37.55 
 
 
385 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.214431  normal  0.01039 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14731  integral membrane protein  42.93 
 
 
369 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.961128  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0998  PilT protein-like protein  47.42 
 
 
361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00567105  normal  0.0135719 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0094  hypothetical protein  24.79 
 
 
161 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0130  Nucleotide binding protein PINc  32.56 
 
 
161 aa  46.6  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.285361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>