46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2940 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  731    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  42.05 
 
 		 354 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  42.65 
 
 		 355 aa  292  6e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  40.86 
 
 		 357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  40.74 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  39.13 
 
 		 350 aa  259  6e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  37.18 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  35.42 
 
 		 343 aa  206  7e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  34.93 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  33.05 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  32.75 
 
 		 342 aa  196  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  29.01 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1610  hypothetical protein  28.57 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.589994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  26.2 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0486  hypothetical protein  23.65 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  26.94 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1905  hypothetical protein  26.39 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000983777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  25.93 
 
 		 341 aa  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0157  hypothetical protein  24.86 
 
 		 346 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.050651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  27.71 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  27.51 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  27.51 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  27.51 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  26.37 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  26.3 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  26.59 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  23.94 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3561  hypothetical protein  22.27 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  27.65 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  22.65 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  23.84 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.51 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1722  hypothetical protein  25.11 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135438  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  24.72 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  26.14 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  26.18 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  23.76 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  26.41 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2840  methionine synthase vitamin-B12 independent  23.99 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.15 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  37.5 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  21.8 
 
 		 372 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  23.65 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2350  hypothetical protein  21.15 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1108  methionine synthase vitamin-B12 independent  23.24 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.25103  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1215  methionine synthase, vitamin-B12 independent  24.48 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>