25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2844 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
457 aa  892    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  35.8 
 
 
448 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  36.83 
 
 
442 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  28.08 
 
 
468 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0724  polysaccharide biosynthesis protein  32.27 
 
 
448 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3499  polysaccharide biosynthesis protein  32.48 
 
 
451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 
418 aa  123  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2971  O antigen flippase  25.64 
 
 
461 aa  118  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.436606  hitchhiker  0.000000132287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4935  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 
442 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 
457 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3785  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 
442 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2321  putative O-antigen transporter  23.65 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0603153  normal  0.0137212 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2314  putative O-antigen transporter  23.77 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0335708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 
504 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3186  LPS side chain defect: putative O-antigen transferase  23.06 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.15241  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  21.17 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2213  putative O-antigen transporter  23.91 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163882  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 
513 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2427  putative O-antigen transporter  24.82 
 
 
427 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.279606  hitchhiker  0.000454993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 
522 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 
446 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 
499 aa  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  24.37 
 
 
445 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  20.53 
 
 
501 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  20.09 
 
 
504 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>