64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0312 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0312  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  100 
 
 		 195 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.434992 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0787  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like  63.27 
 
 		 196 aa  257  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0620  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like  48.72 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0403  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  30.3 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2526  autoinducer synthesis protein  31.33 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1227  N-acyl homoserine lactone synthase  29.19 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1658  autoinducer synthetase  30.11 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0115176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1577  autoinducer synthetase  30.11 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0145  N-acylhomoserine lactone synthase  30.11 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0460086  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  29.29 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0322  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  28.79 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0415  putative autoinducer synthesis protein  29.65 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4583  autoinducer synthesis protein  29.78 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141788  hitchhiker  0.0000655879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4118  autoinducer synthesis protein  29.21 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000553872  hitchhiker  0.00840845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  26.38 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1221  autoinducer synthase BpsI  29.41 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.653596  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1293  autoinducer synthase BpsI  29.41 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1050  autoinducer synthesis protein  29.21 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000000830053  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2483  N-acylhomoserine lactone synthase  29.41 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0960  autoinducer synthase BpsI  29.41 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2589  autoinducer synthesis protein  25.99 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5574  autoinducer synthesis protein  28.65 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000539644  hitchhiker  0.00691296 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1347  autoinducer synthetase family protein  29.41 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0331  autoinducer synthase BpsI  29.41 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0609  autoinducer synthase BpsI  29.41 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1512  N-acyl homoserine lactone synthase  28.49 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0575581  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1710  autoinducer synthesis protein  28.48 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0765757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3811  autoinducer synthesis protein  25 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3286  autoinducer synthesis protein SOLI  29.47 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3641  autoinducer synthesis protein  27.68 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000011065  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  25.29 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4726  autoinducer synthesis protein  27.68 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455128  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1650  autoinducer synthesis protein RhlI  28.65 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  33.98 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01928  autoinducer synthase  29.66 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.697337 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  29.44 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.852162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  29.44 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  24.71 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19130  autoinducer synthesis protein RhlI  25.99 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347386  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.46 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4437  autoinducer synthesis protein  25 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  27.22 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1760  autoinducer synthesis protein  27.88 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  27.75 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0126  autoinducer synthesis protein  27.52 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0123  autoinducer synthesis protein  27.88 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1765  autoinducer synthesis protein  26.32 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  24.54 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2668  autoinducer synthesis protein  23.84 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2022  autoinducer synthetase  29.14 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0700  autoinducer synthetase BpmI  29.14 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1577  N-acyl homoserine lactone synthase  29.14 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2129  autoinducer synthetase BpmI  29.14 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.466862  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0965  Acyl-homoserine-lactone synthase  25.41 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.397594  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5763  autoinducer synthesis protein  25.86 
 
 		 207 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3969  autoinducer synthesis protein  28.48 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163172  normal  0.0220737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0919  autoinducer synthesis protein  25.75 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142092 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0618  N-acylhomoserine lactone synthase  29.14 
 
 		 289 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0541466  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2216  autoinducer synthetase BpmI  29.14 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0690156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2029  autoinducer synthesis protein  26.14 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2929  autoinducer synthesis protein  21.18 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  24.28 
 
 		 203 aa  41.2  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1621  autoinducer synthesis protein  26.17 
 
 		 226 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672835  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7113  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  24.21 
 
 		 227 aa  41.2  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.575549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>