More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1856 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  100 
 
 
328 aa  665  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  1.27856e-11  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  55.59 
 
 
324 aa  349  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  60.43 
 
 
319 aa  332  6e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  57.19 
 
 
316 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  56.1 
 
 
318 aa  308  1e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  55.05 
 
 
315 aa  308  1e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  47.26 
 
 
341 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  47.26 
 
 
313 aa  293  4e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  51.65 
 
 
324 aa  289  5e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  47.04 
 
 
330 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  45.09 
 
 
315 aa  273  2e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  47.13 
 
 
315 aa  272  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  50.46 
 
 
310 aa  268  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  50.46 
 
 
310 aa  268  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  1.17807e-08 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  52.91 
 
 
316 aa  266  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.22637e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.24 
 
 
323 aa  265  6e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  46.36 
 
 
327 aa  263  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  46.34 
 
 
313 aa  262  7e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  43.6 
 
 
313 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.84 
 
 
324 aa  254  2e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.64 
 
 
315 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.38 
 
 
325 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  42.51 
 
 
326 aa  249  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  44.71 
 
 
326 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  46.69 
 
 
304 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.24 
 
 
317 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  42.47 
 
 
307 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  44.98 
 
 
308 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  45.43 
 
 
297 aa  246  5e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  48.68 
 
 
313 aa  245  7e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  42.86 
 
 
313 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  44.51 
 
 
314 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.88 
 
 
319 aa  239  6e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.68 
 
 
313 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  44.51 
 
 
313 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.57 
 
 
325 aa  236  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  42.09 
 
 
320 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0647  chaperone DnaJ domain protein  44.35 
 
 
337 aa  235  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  45.18 
 
 
319 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  42.06 
 
 
335 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.18 
 
 
319 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  44.85 
 
 
314 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.76 
 
 
323 aa  228  9e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  41.72 
 
 
333 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  44.85 
 
 
314 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  43.2 
 
 
321 aa  226  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  40.63 
 
 
339 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  38.78 
 
 
335 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  40.85 
 
 
306 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  40.85 
 
 
306 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  40.85 
 
 
306 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  40.85 
 
 
306 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  40.85 
 
 
306 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  38.48 
 
 
335 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  40.12 
 
 
306 aa  221  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  40.12 
 
 
306 aa  221  1e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.49 
 
 
289 aa  221  1e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.95 
 
 
319 aa  221  1e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  40.12 
 
 
306 aa  221  1e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  45.29 
 
 
294 aa  221  1e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.31 
 
 
326 aa  221  1e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  41.12 
 
 
326 aa  221  1e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  40.12 
 
 
306 aa  221  1e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  40.12 
 
 
306 aa  221  1e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  40.12 
 
 
306 aa  221  1e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.54 
 
 
351 aa  220  2e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  38.79 
 
 
311 aa  220  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  39.82 
 
 
306 aa  219  4e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  44.55 
 
 
316 aa  219  4e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  39.82 
 
 
306 aa  219  4e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  39.82 
 
 
306 aa  219  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  37.05 
 
 
301 aa  218  8e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.62 
 
 
318 aa  218  9e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  39.39 
 
 
335 aa  216  3e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.12 
 
 
347 aa  216  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  35.94 
 
 
337 aa  215  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  42.99 
 
 
320 aa  215  1e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  42.23 
 
 
324 aa  213  2e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  38.08 
 
 
299 aa  213  4e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  42.81 
 
 
295 aa  212  5e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  40 
 
 
340 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  42.3 
 
 
318 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.95 
 
 
334 aa  210  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.56 
 
 
331 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  37.54 
 
 
377 aa  209  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4186  chaperone DnaJ domain protein  37.64 
 
 
333 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  34.29 
 
 
374 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  39.4 
 
 
309 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.5 
 
 
287 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0791  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.12 
 
 
323 aa  206  6e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  1.79186e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.39 
 
 
324 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.17 
 
 
315 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.64 
 
 
334 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  7.66624e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.2 
 
 
392 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  39.09 
 
 
304 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  36.1 
 
 
333 aa  202  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  35.81 
 
 
395 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  3.40868e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  35.49 
 
 
311 aa  202  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  36.6 
 
 
333 aa  201  1e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  41.77 
 
 
309 aa  201  1e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>