More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0190 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0190  Patatin  100 
 
 		 314 aa  649    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  37.58 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  36.93 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  36.54 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  36.57 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  34.29 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  37.5 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  38.03 
 
 		 310 aa  188  8e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  34.64 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  35.24 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  34.6 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  34.92 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  34.92 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  34.92 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  34.92 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  34.92 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  34.92 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  34.92 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  34.97 
 
 		 304 aa  179  8e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  31.53 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  37.54 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  34.67 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  34.6 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  31.41 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  33 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  31.9 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  33.02 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  32.45 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  32.7 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  32.7 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  32.7 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  32.7 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  32.47 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  32.69 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  32.58 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  32.58 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  31.83 
 
 		 303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  33.88 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  31.31 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  31.11 
 
 		 354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  33.44 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  32.59 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  31.38 
 
 		 352 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  35.2 
 
 		 256 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  30.43 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3119  Patatin  35.71 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  32 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2451  patatin  34.09 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  33.77 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  32.58 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  33.44 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  33.12 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  31.93 
 
 		 343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  32.48 
 
 		 343 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  31.38 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  29.97 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  31.63 
 
 		 390 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  31.94 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  31.8 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  31.8 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  31.31 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  29.9 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  29.6 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  32.79 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  32.79 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  32.79 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  32.79 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  33.55 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2340  alpha-beta hydrolase family esterase  31.66 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  35.4 
 
 		 263 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  32.19 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  32.19 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1538  patatin  33.33 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.546797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  46.89 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  30.59 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  36.41 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2513  patatin  32.3 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  33.92 
 
 		 373 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  31.58 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  35.02 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  30.55 
 
 		 276 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2443  patatin  32.75 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  45.74 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2605  patatin  32.4 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1595  patatin  32.65 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.613745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  34.56 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.56 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  29.71 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  34.56 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2836  hypothetical protein  32.06 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4687  patatin  29.91 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257253  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  34.56 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  34.56 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  34.56 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  34.56 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2071  Patatin  29.52 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  29.74 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  34.1 
 
 		 263 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  28.03 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2469  patatin  29.75 
 
 		 347 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.504238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>