More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0648 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  52.4 
 
 		 659 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.28 
 
 		 614 aa  658    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  100 
 
 		 650 aa  1293    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  54.25 
 
 		 663 aa  682    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  52.62 
 
 		 661 aa  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  51.5 
 
 		 616 aa  624  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  47.87 
 
 		 607 aa  610  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  46.66 
 
 		 607 aa  528  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  45.05 
 
 		 634 aa  479  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  40.47 
 
 		 657 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  41.1 
 
 		 665 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  40.12 
 
 		 662 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  39.6 
 
 		 663 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  39.69 
 
 		 663 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  38.91 
 
 		 663 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  38.75 
 
 		 663 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.56 
 
 		 649 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  38.24 
 
 		 664 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2250  small GTP-binding protein  37.89 
 
 		 689 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.633777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  38.41 
 
 		 654 aa  399  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.39 
 
 		 688 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  37.25 
 
 		 688 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  36.95 
 
 		 688 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3531  small GTP-binding protein  37.32 
 
 		 654 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.000000246563  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.9 
 
 		 571 aa  331  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  34.54 
 
 		 623 aa  325  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2489  small GTP-binding protein  32.48 
 
 		 571 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05070  Ferrous iron transporter protein FeoB  31.74 
 
 		 607 aa  303  8.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000363083  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  33.95 
 
 		 658 aa  300  4e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  32.63 
 
 		 576 aa  295  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  33.12 
 
 		 576 aa  296  1e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  32.47 
 
 		 576 aa  293  8e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0703  small GTP-binding protein  31.13 
 
 		 572 aa  291  3e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.313338  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  32.19 
 
 		 624 aa  291  3e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  30.11 
 
 		 610 aa  283  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  33.18 
 
 		 637 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  30 
 
 		 662 aa  278  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  33.81 
 
 		 616 aa  276  7e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  31.28 
 
 		 619 aa  273  9e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  29.97 
 
 		 657 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1073  small GTP-binding protein  30.55 
 
 		 650 aa  265  2e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  28.82 
 
 		 620 aa  258  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  30.02 
 
 		 606 aa  257  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1076  ferrous iron transport B-like  37.89 
 
 		 487 aa  250  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05920  Ferrous iron transport protein FeoB  35.47 
 
 		 480 aa  250  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000073202  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0529  small GTP-binding protein  30.97 
 
 		 587 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  30.07 
 
 		 587 aa  243  9e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  28.8 
 
 		 631 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  30.07 
 
 		 587 aa  240  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  29.55 
 
 		 646 aa  239  8e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  28.61 
 
 		 691 aa  239  9e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0198  ferrous iron transport protein B  30.02 
 
 		 645 aa  239  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  28.18 
 
 		 631 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3029  small GTP-binding protein  32.21 
 
 		 635 aa  236  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.690914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1800  Ferrous iron transport B domain protein  36.16 
 
 		 488 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1713  ferrous iron transport protein B  29.07 
 
 		 645 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.340113  normal  0.969498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1828  nucleoside recognition domain protein  35.91 
 
 		 488 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  27.67 
 
 		 647 aa  224  4e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  27.44 
 
 		 712 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  28.26 
 
 		 647 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  30.29 
 
 		 786 aa  221  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  30.41 
 
 		 721 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  29.98 
 
 		 680 aa  220  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  28.13 
 
 		 647 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  31.63 
 
 		 770 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  28.23 
 
 		 665 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  28.87 
 
 		 688 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  30.76 
 
 		 649 aa  217  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2690  ferrous iron transport protein B  31.21 
 
 		 764 aa  217  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  26.64 
 
 		 669 aa  217  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  29.68 
 
 		 676 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  27.51 
 
 		 664 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  26.34 
 
 		 667 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  30.23 
 
 		 741 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  27.8 
 
 		 662 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  31.18 
 
 		 776 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  27.95 
 
 		 662 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  26.92 
 
 		 664 aa  214  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  27.1 
 
 		 662 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  26.92 
 
 		 664 aa  214  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  27.8 
 
 		 662 aa  213  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  27.8 
 
 		 662 aa  213  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  27.2 
 
 		 662 aa  213  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  30.36 
 
 		 770 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  27.8 
 
 		 662 aa  213  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  27.41 
 
 		 662 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  28.63 
 
 		 848 aa  212  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  29.29 
 
 		 778 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  27.64 
 
 		 662 aa  211  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  26.78 
 
 		 680 aa  211  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  29.49 
 
 		 740 aa  211  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  27.64 
 
 		 662 aa  210  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  28.77 
 
 		 662 aa  210  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  31.1 
 
 		 772 aa  210  8e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  29.27 
 
 		 786 aa  209  9e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  28.94 
 
 		 717 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  29.43 
 
 		 740 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1584  ferrous iron transport protein B  29.17 
 
 		 764 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000129381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  30.14 
 
 		 774 aa  207  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  26.8 
 
 		 664 aa  207  6e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>