More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0620 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
512 aa  1021    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000106495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.88 
 
 
528 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.66 
 
 
519 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0927  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.21 
 
 
572 aa  272  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1675  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 
572 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  36.44 
 
 
533 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.76 
 
 
533 aa  257  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.66 
 
 
533 aa  250  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.21 
 
 
520 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000607785  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1228  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.03 
 
 
523 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.429585  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.63 
 
 
679 aa  223  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0287  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.24 
 
 
564 aa  223  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 
532 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
532 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.94 
 
 
576 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886832 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 
452 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.23 
 
 
574 aa  203  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.16 
 
 
572 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
598 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1303  methyl-accepting chemotaxis protein  32.43 
 
 
494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.08 
 
 
572 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  34.82 
 
 
544 aa  193  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 
564 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.51 
 
 
571 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 
525 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.94 
 
 
731 aa  191  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.723997  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.92 
 
 
556 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  33.03 
 
 
549 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 
525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.34 
 
 
588 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.031352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.72 
 
 
547 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.04 
 
 
547 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 
549 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  35.23 
 
 
660 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0945  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.13 
 
 
675 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.870162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.54 
 
 
571 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.43 
 
 
619 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0042391  normal  0.0195698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.76 
 
 
661 aa  182  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3073  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.76 
 
 
677 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.33 
 
 
528 aa  181  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0086081  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 
547 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 
569 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2151  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 
707 aa  180  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0652  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.71 
 
 
520 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0957566  hitchhiker  0.0000000067445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  34.96 
 
 
650 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  34.96 
 
 
650 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  34.12 
 
 
660 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  31.94 
 
 
658 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.31 
 
 
637 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  30.37 
 
 
660 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.01 
 
 
660 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.04 
 
 
660 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  30.59 
 
 
650 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.08 
 
 
545 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1557  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.73 
 
 
530 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.57 
 
 
660 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  33.99 
 
 
549 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.98 
 
 
676 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.776318  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  29.56 
 
 
660 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 
544 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  32.55 
 
 
658 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  30.96 
 
 
660 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  32.28 
 
 
658 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  31.98 
 
 
660 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.33 
 
 
570 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  32.28 
 
 
658 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  32.53 
 
 
660 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 
563 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  32.28 
 
 
658 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
557 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  29.6 
 
 
658 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 
667 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000234524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  32.87 
 
 
658 aa  174  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.13 
 
 
678 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0897525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.7 
 
 
650 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.06 
 
 
535 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  28.26 
 
 
660 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  32.6 
 
 
658 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  31.7 
 
 
658 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  30.96 
 
 
660 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  28.29 
 
 
660 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  30.96 
 
 
660 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  30.96 
 
 
660 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  30.96 
 
 
660 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  30.96 
 
 
660 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  28.51 
 
 
660 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0740  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.54 
 
 
596 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000672019  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.27 
 
 
632 aa  170  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  34.93 
 
 
539 aa  170  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  35.44 
 
 
541 aa  170  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  28.01 
 
 
660 aa  170  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  28.29 
 
 
660 aa  170  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 
674 aa  170  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  32.47 
 
 
628 aa  169  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0063  methyl-accepting chemotaxis protein  33.68 
 
 
563 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000482836  normal  0.0217071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.91 
 
 
544 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  28.07 
 
 
660 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 
546 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  28.07 
 
 
660 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>