93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0140 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
334 aa  695    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
334 aa  695    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  59.28 
 
 
343 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.73743 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0568  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.77 
 
 
342 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1356  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.53 
 
 
346 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.128683  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17800  4Fe-4S protein  41.07 
 
 
341 aa  278  9e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0815  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.95 
 
 
333 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00070784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1330  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.9 
 
 
344 aa  268  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.52 
 
 
350 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3430  heterodisulfide reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  42.55 
 
 
342 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.67 
 
 
334 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3586  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.67 
 
 
334 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.75 
 
 
337 aa  257  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1032  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  38.24 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.203704  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1212  hydrogenase, putative  39.71 
 
 
359 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0401  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.87 
 
 
339 aa  248  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1303  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  37.65 
 
 
337 aa  247  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1257  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.85 
 
 
337 aa  245  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1112  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  37.22 
 
 
337 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.338031 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.76 
 
 
336 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0026  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.98 
 
 
336 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0830  hydrogenase, putative  36.96 
 
 
359 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379475  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0326  hydrogenase, putative  37.68 
 
 
363 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.384947 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0193  iron-sulfur binding protein  38.96 
 
 
349 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2312  iron-sulfur binding protein  38.96 
 
 
349 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2102  hydrogenase, putative  39.13 
 
 
357 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0303976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0853  hydrogenase, putative  35.65 
 
 
342 aa  235  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0087  heterodisulfide reductase, iron-sulfur binding subunit, putative  37.85 
 
 
334 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0867  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.85 
 
 
334 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3529  hydrogenase, putative  33.92 
 
 
362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1253  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  34.43 
 
 
345 aa  202  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2659  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  32.77 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0525885  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2586  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.34 
 
 
379 aa  192  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0503  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.87 
 
 
386 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213945  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2664  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.16 
 
 
391 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1015  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.91 
 
 
389 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582823 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0912  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.41 
 
 
329 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.974369  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0083  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.45 
 
 
339 aa  178  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.249908  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04360  Soluble hydrogenase, alpha or beta chain  32.33 
 
 
382 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1971  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  34.64 
 
 
325 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1861  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.45 
 
 
356 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.292424  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1134  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.23 
 
 
375 aa  172  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0260075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4500  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.89 
 
 
395 aa  172  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1926  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  29.71 
 
 
359 aa  169  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2602  Ni/Fe hydrogenase beta subunit  31.61 
 
 
345 aa  169  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4823  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.09 
 
 
357 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1260  hypothetical protein  34.01 
 
 
373 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.62411  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.66 
 
 
325 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2129  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  29.41 
 
 
359 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.33959  hitchhiker  0.00742423 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2390  hypothetical protein  30.3 
 
 
379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2535  hypothetical protein  30.03 
 
 
379 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3471  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.94 
 
 
370 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.495148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0881  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.67 
 
 
349 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1058  hypothetical protein  31.44 
 
 
368 aa  159  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637836  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0940  [NiFe] hydrogenase, beta subunit, putative  31.44 
 
 
368 aa  159  8e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2166  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  27.06 
 
 
359 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2094  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  27.57 
 
 
359 aa  155  8e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2798  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  27.95 
 
 
360 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2789  putative anaerobic sulfite reductase, A subunit  27.95 
 
 
360 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2496  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  25.81 
 
 
359 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1125  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.82 
 
 
327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1566  hydrogenase/sulfur reductase, beta subunit  25.59 
 
 
359 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.88 
 
 
340 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0381801  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3482  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29 
 
 
352 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0532647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3430  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29 
 
 
352 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259101  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3419  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29 
 
 
352 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1427  sulfite reductase, iron-sulfur subunit  28.22 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131604  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1693  sulfite reductase, iron-sulfur subunit  28.4 
 
 
338 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.060829  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.86 
 
 
349 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1601  sulfite reductase, subunit A  25.07 
 
 
337 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0555  sulfite reductase, subunit A  26.75 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1789  anaerobic sulfite reductase, A subunit  26.69 
 
 
343 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0801796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2923  sulfite reductase, subunit A  28.17 
 
 
347 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2703  sulfite reductase, subunit A  28.17 
 
 
347 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.15911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2810  sulfite reductase subunit A  28.17 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2748  sulfite reductase subunit A  28.17 
 
 
347 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2789  sulfite reductase subunit A  27.89 
 
 
347 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427719  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.9 
 
 
277 aa  49.7  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.94097  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1031  hydrogenase, iron-sulfur binding protein, putative  30.11 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1258  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.25 
 
 
276 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0822  formate dehydrogenase  23.74 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1355  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.27 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.420984  normal  0.358131 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.42 
 
 
308 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0980  Formate dehydrogenase  23.39 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000894314  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1331  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.78 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.77 
 
 
276 aa  43.5  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.04 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.04 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0567  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.2 
 
 
328 aa  43.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.04 
 
 
314 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0088  heterodisulfide reductase subunit  24.04 
 
 
309 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.04 
 
 
314 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2660  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.12 
 
 
339 aa  42.4  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.403976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>