139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0407 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0407  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 595 aa  1233    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1417  Fe-S oxidoreductase, radical SAM domain protein  53.33 
 
 		 583 aa  635    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1109  Radical SAM domain protein  51.06 
 
 		 571 aa  599  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.890323  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0262  radical SAM domain-containing protein  48.58 
 
 		 568 aa  529  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.282617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0582  radical SAM domain-containing protein  48.57 
 
 		 567 aa  515  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0596  radical SAM domain-containing protein  48.57 
 
 		 567 aa  515  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.578273  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1506  radical SAM domain-containing protein  45.08 
 
 		 554 aa  500  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0603  hypothetical protein  42.41 
 
 		 683 aa  485  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1216  hypothetical protein  43.16 
 
 		 662 aa  477  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364904  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2444  radical SAM domain-containing protein  46.43 
 
 		 640 aa  476  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1407  hypothetical protein  43.16 
 
 		 662 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00374356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1094  hypothetical protein  40.99 
 
 		 639 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0145194  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2328  Radical SAM domain protein  44.4 
 
 		 666 aa  466  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3616  hypothetical protein  42.63 
 
 		 685 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0689  radical SAM family protein  45.24 
 
 		 671 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0915  Radical SAM domain protein  43.59 
 
 		 599 aa  458  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3346  Radical SAM domain protein  44.48 
 
 		 598 aa  458  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0576598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7218  hypothetical protein  44.34 
 
 		 674 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6215  radical SAM domain-containing protein  44.44 
 
 		 679 aa  458  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.310596 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2132  hypothetical protein  41.31 
 
 		 620 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4193  Radical SAM domain protein  44.62 
 
 		 678 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11120  Fe-S oxidoreductase  42.63 
 
 		 718 aa  453  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390145  normal  0.0549005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1858  radical SAM domain-containing protein  45.57 
 
 		 600 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3126  hypothetical protein  42.6 
 
 		 642 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0311249  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4610  radical SAM domain-containing protein  44.62 
 
 		 688 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159872 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1897  Fe-S oxidoreductase  42.86 
 
 		 625 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117655  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0746  Radical SAM domain protein  43.81 
 
 		 677 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5075  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 		 688 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0942  radical SAM domain-containing protein  44.52 
 
 		 679 aa  452  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4160  hypothetical protein  40.86 
 
 		 687 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0609  radical SAM family protein  44.39 
 
 		 603 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00147953  hitchhiker  0.00191958 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1776  hypothetical protein  41.81 
 
 		 622 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1538  radical SAM domain-containing protein  46.78 
 
 		 598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.415289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0068  radical SAM domain-containing protein  41.47 
 
 		 658 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.514908  normal  0.0285773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2003  radical SAM family protein  43.87 
 
 		 707 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0066  radical SAM family protein  41.56 
 
 		 648 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0072  Radical SAM domain protein  42.66 
 
 		 648 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0293  hypothetical protein  42.13 
 
 		 710 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0084  Radical SAM domain protein  42.66 
 
 		 648 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.028481  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1632  extracellular solute-binding protein  44.18 
 
 		 612 aa  437  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0281  Radical SAM domain protein  42.75 
 
 		 589 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1103  radical SAM domain-containing protein  45.26 
 
 		 673 aa  435  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1972  Radical SAM domain protein  43.24 
 
 		 621 aa  432  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270598  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0556  radical SAM domain-containing protein  41.74 
 
 		 623 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.837617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02777  hypothetical protein  40.61 
 
 		 787 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1052  radical SAM domain-containing protein  41.12 
 
 		 605 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.173598  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3187  Radical SAM domain protein  42.22 
 
 		 607 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00436822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02888  hypothetical protein  40.16 
 
 		 739 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0684  Radical SAM domain protein  40.16 
 
 		 739 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4327  hypothetical protein  40.16 
 
 		 739 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1403  Radical SAM domain protein  39.23 
 
 		 630 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.59751 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3194  hypothetical protein  40.16 
 
 		 739 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3484  hypothetical protein  40.16 
 
 		 739 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0681  hypothetical protein  40.16 
 
 		 739 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3300  hypothetical protein  40.16 
 
 		 739 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0672097 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02838  hypothetical protein  40.16 
 
 		 739 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0945  hypothetical protein  40.19 
 
 		 657 aa  422  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3424  hypothetical protein  40.46 
 
 		 723 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3349  hypothetical protein  40.46 
 
 		 723 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3519  hypothetical protein  40.46 
 
 		 723 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3418  hypothetical protein  40.13 
 
 		 723 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3352  hypothetical protein  40.46 
 
 		 723 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4234  hypothetical protein  40.24 
 
 		 721 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.577109 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003066  hypothetical protein  40.61 
 
 		 781 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3451  hypothetical protein  40 
 
 		 739 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1013  Radical SAM domain protein  41.72 
 
 		 607 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000409081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2873  radical SAM domain-containing protein  43.09 
 
 		 605 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3424  hypothetical protein  40.54 
 
 		 724 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0652  hypothetical protein  39.83 
 
 		 763 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000231874 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1314  hypothetical protein  39.67 
 
 		 789 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1364  radical SAM domain-containing protein  38.76 
 
 		 755 aa  415  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206829 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1409  Radical SAM domain protein  41.64 
 
 		 614 aa  414  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2153  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.81 
 
 		 763 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1359  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.52 
 
 		 646 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2271  radical SAM domain-containing protein  39.2 
 
 		 770 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01783  hypothetical protein  41.17 
 
 		 791 aa  412  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2297  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.62 
 
 		 620 aa  403  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3203  radical SAM domain-containing protein  38.42 
 
 		 752 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.939016  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0934  hypothetical protein  39.56 
 
 		 634 aa  394  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.157188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1188  Radical SAM domain protein  40.33 
 
 		 740 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2985  Radical SAM domain protein  39.77 
 
 		 771 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.5382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0819  radical SAM domain-containing protein  38.69 
 
 		 680 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0311  hypothetical protein  37.26 
 
 		 786 aa  362  8e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2121  Radical SAM domain protein  36.39 
 
 		 746 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0233  hypothetical protein  36.12 
 
 		 780 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07700  hypothetical protein  41.64 
 
 		 757 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.568115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2898  radical SAM family protein  39.06 
 
 		 724 aa  260  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.041487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1996  radical SAM family protein  41.74 
 
 		 740 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2008  hypothetical protein  39.19 
 
 		 817 aa  253  6e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0530056  normal  0.455739 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3816  radical SAM domain-containing protein  40.7 
 
 		 796 aa  249  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0939  radical SAM family protein  40.79 
 
 		 745 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.342945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1083  radical SAM family protein  40.79 
 
 		 745 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1663  Radical SAM domain protein  39.61 
 
 		 745 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0585  hypothetical protein  40.54 
 
 		 787 aa  247  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0355  hypothetical protein  39.6 
 
 		 812 aa  246  6e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0666  hypothetical protein  40.54 
 
 		 775 aa  246  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0324  hypothetical protein  39.3 
 
 		 815 aa  246  6.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5654  hypothetical protein  40 
 
 		 747 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65080  hypothetical protein  40 
 
 		 747 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4872  hypothetical protein  40.64 
 
 		 766 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783093  normal  0.109803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>