More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0087 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
83 aa  167  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.79495e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  78.31 
 
 
88 aa  130  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  79.49 
 
 
89 aa  125  2e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  84.29 
 
 
88 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1379  50S ribosomal protein L27  74.68 
 
 
89 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 
84 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.53633e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2057  50S ribosomal protein L27  74.36 
 
 
87 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 
92 aa  119  1e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2249  50S ribosomal protein L27  81.43 
 
 
89 aa  117  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
84 aa  116  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.60272e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  66.67 
 
 
91 aa  115  2e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 
89 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
85 aa  112  1e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.90958e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
85 aa  112  2e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
95 aa  112  2e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
93 aa  112  2e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
85 aa  112  2e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.93871e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
87 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
85 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  4.79005e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
84 aa  111  4e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
85 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
85 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
84 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.97888e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
85 aa  109  1e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  3.51057e-09  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  72 
 
 
86 aa  110  1e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  109  2e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  9.11893e-12  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  68.29 
 
 
85 aa  109  2e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  67.07 
 
 
86 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  63.1 
 
 
84 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  2.26179e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1847  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  75.71 
 
 
88 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
94 aa  108  4e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
84 aa  107  4e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
85 aa  107  4e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  2.22447e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
87 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  3.24123e-05  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.10399e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
85 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
87 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4334  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
85 aa  107  7e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4181  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
85 aa  107  7e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186505  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4312  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
85 aa  107  7e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  107  8e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  107  8e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  2.03934e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  64.71 
 
 
85 aa  107  8e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.26464e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  66.23 
 
 
87 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  105  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.50774e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  105  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
84 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.60226e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  64.71 
 
 
85 aa  105  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  105  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  9.67389e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  105  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  6.0246e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 
85 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
84 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.82867e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  105  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  7.94781e-06  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
84 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  9.11721e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0426  50S ribosomal protein L27  63.75 
 
 
89 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  105  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
84 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.53229e-06  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  105  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.3922e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  105  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.91459e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0526  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
85 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.40306e-15  unclonable  7.87501e-24 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
85 aa  105  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.91049e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
85 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  65 
 
 
93 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
85 aa  104  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  1.36289e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
98 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.63692e-08  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
85 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.70517e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.10997e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4859  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
85 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
85 aa  104  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  104  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  5.45576e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  59.04 
 
 
93 aa  104  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  8.37185e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  103  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  104  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  3.22672e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
90 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  103  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  9.45082e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 
88 aa  103  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  103  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.09766e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4327  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
85 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
85 aa  103  8e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
84 aa  103  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.13295e-07  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
85 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  8.00329e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
84 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 
89 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
86 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.34792e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
84 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.52445e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 
89 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  62.35 
 
 
85 aa  102  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>