More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0041 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0041  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
501 aa  1042  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0492791  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2903  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.49 
 
 
502 aa  551  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.10986e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0203  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.9 
 
 
503 aa  531  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4353  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.73 
 
 
385 aa  164  5e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.23 
 
 
387 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  27.43 
 
 
378 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.71414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28760  acyl-CoA dehydrogenase  26.2 
 
 
382 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.0971486 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1058  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.88 
 
 
386 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.405365  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08440  acyl-CoA dehydrogenase  26.65 
 
 
389 aa  141  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.231358  normal  0.194083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.66 
 
 
390 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  6.83478e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.66 
 
 
390 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.88 
 
 
379 aa  136  1e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0298  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.19 
 
 
381 aa  134  4e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.73 
 
 
380 aa  133  8e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0762  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.57 
 
 
381 aa  133  8e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  0.783766 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  25.6 
 
 
379 aa  133  8e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.08426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1647  acyl-CoA dehydrogenase  26.19 
 
 
385 aa  132  1e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.658516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.61 
 
 
387 aa  132  2e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.91 
 
 
379 aa  131  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1317  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.86 
 
 
388 aa  130  4e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1336  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.86 
 
 
388 aa  130  4e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1300  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.86 
 
 
388 aa  130  4e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  25.81 
 
 
379 aa  130  4e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86159e-14 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  25.81 
 
 
379 aa  130  5e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0428  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.6 
 
 
380 aa  130  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.871589  normal  0.2576 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.94 
 
 
379 aa  130  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  1.00384e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  25.81 
 
 
379 aa  130  7e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  25.81 
 
 
379 aa  130  7e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  25.16 
 
 
379 aa  129  9e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  25.6 
 
 
379 aa  129  1e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6843  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 
393 aa  129  1e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.11 
 
 
379 aa  128  2e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  25.6 
 
 
379 aa  129  2e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.9 
 
 
387 aa  129  2e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.16 
 
 
384 aa  129  2e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  25.6 
 
 
379 aa  128  2e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6030  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.79 
 
 
391 aa  128  2e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.83 
 
 
377 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25 
 
 
385 aa  126  8e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  25.11 
 
 
379 aa  126  8e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  25.11 
 
 
379 aa  126  8e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.45 
 
 
383 aa  126  8e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.36 
 
 
386 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.01 
 
 
380 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.78 
 
 
383 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1526  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.91 
 
 
404 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.84855  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0409  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.56 
 
 
406 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1084  butyryl-CoA dehydrogenase  26.27 
 
 
377 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3365  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.81 
 
 
381 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.06 
 
 
375 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1549  butyryl-CoA dehydrogenase  25.81 
 
 
387 aa  123  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.431805  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1835  butyryl-CoA dehydrogenase  25.16 
 
 
379 aa  123  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.571593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.06 
 
 
389 aa  123  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.64 
 
 
380 aa  123  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3281  acyl-CoA dehydrogenase-like  26.51 
 
 
395 aa  122  1e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.61 
 
 
389 aa  122  1e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1390  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.41 
 
 
390 aa  122  2e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.73 
 
 
379 aa  122  2e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.45 
 
 
376 aa  122  2e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.672922 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1625  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.23 
 
 
400 aa  122  2e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0934  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.88 
 
 
387 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.496704 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  24.24 
 
 
379 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1490  butyryl-CoA dehydrogenase  26.7 
 
 
378 aa  120  4e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2695  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.22 
 
 
382 aa  120  5e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3936  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.73 
 
 
376 aa  120  5e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132156  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.57 
 
 
380 aa  120  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0226  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.49 
 
 
388 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.597403  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.58 
 
 
386 aa  120  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4480  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.06 
 
 
381 aa  119  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.155011  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.64 
 
 
389 aa  119  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  25 
 
 
380 aa  119  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.11 
 
 
386 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2684  putative acyl-CoA dehydrogenase  25.83 
 
 
375 aa  119  1e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1371  butyryl-CoA dehydrogenase  26.84 
 
 
389 aa  119  1e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.183303  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0247  Acyl-CoA dehydrogenase  23.7 
 
 
378 aa  118  2e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4743  butyryl-CoA dehydrogenase  26.76 
 
 
417 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0623  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.43 
 
 
391 aa  117  4e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31540  putative acyl-CoA dehydrogenase  25.61 
 
 
375 aa  117  4e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.430124  hitchhiker  9.5284e-05 
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  24.62 
 
 
379 aa  117  4e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4257  putative acyl-CoA dehydrogenase  24.77 
 
 
376 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2949  acyl-CoA dehydrogenase-like  24.02 
 
 
388 aa  117  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13303  acyl-CoA dehydrogenase fadE25  27.64 
 
 
389 aa  117  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0714  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.06 
 
 
388 aa  117  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.0860013 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.35 
 
 
383 aa  116  8e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.49 
 
 
379 aa  116  8e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  24.28 
 
 
377 aa  116  8e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4214  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.41 
 
 
386 aa  116  9e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.234142  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.28 
 
 
377 aa  116  9e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.39 
 
 
381 aa  116  9e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3106  acyl-CoA dehydrogenase-like  25.36 
 
 
375 aa  116  1e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.88 
 
 
384 aa  116  1e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.17 
 
 
377 aa  115  1e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.96 
 
 
377 aa  115  1e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00118834  normal  0.0149252 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4963  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.5 
 
 
377 aa  116  1e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3404  acyl-CoA dehydrogenase-like  24.5 
 
 
377 aa  116  1e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0092  butyryl-CoA dehydrogenase  24.5 
 
 
378 aa  116  1e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.06 
 
 
377 aa  115  2e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351154  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3492  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.12 
 
 
383 aa  115  2e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2279  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.76 
 
 
383 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2436  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.56 
 
 
383 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>