More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0885 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
229 aa  471  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  48.03 
 
 
238 aa  218  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  46.29 
 
 
238 aa  215  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  42.73 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  41.26 
 
 
238 aa  187  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  37.12 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  37.12 
 
 
476 aa  180  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  36.61 
 
 
345 aa  174  9e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  36.77 
 
 
348 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0481  nucleotidyl transferase  38.84 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  35.24 
 
 
348 aa  167  9e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  36.4 
 
 
237 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  35.56 
 
 
346 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  38.57 
 
 
341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  38.64 
 
 
341 aa  161  7e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  33.19 
 
 
238 aa  155  6e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4857  nucleotidyl transferase  36.94 
 
 
351 aa  152  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  34.48 
 
 
843 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0560  nucleotidyl transferase  35.45 
 
 
351 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  32.59 
 
 
361 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 
820 aa  149  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  34.25 
 
 
351 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  36.4 
 
 
840 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  35.27 
 
 
360 aa  148  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.8 
 
 
320 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  35.81 
 
 
841 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  35.68 
 
 
828 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  37.12 
 
 
843 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  35.34 
 
 
841 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2335  putative sugar-phosphate nucleotide transferase  34.22 
 
 
352 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0321237  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  34.09 
 
 
828 aa  145  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  36.56 
 
 
784 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  34.5 
 
 
842 aa  142  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  36.12 
 
 
784 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  36.12 
 
 
784 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  32.6 
 
 
355 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  36.12 
 
 
784 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  36.12 
 
 
784 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  36.12 
 
 
784 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  34.8 
 
 
785 aa  142  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  36.12 
 
 
784 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  36.12 
 
 
784 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  36.12 
 
 
784 aa  141  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0757  nucleotidyl transferase  32.23 
 
 
354 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  36.12 
 
 
784 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
832 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  35.91 
 
 
370 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  34.67 
 
 
854 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  35.62 
 
 
349 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0051  nucleotidyl transferase  36 
 
 
351 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.4 
 
 
343 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  32.88 
 
 
353 aa  138  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  34.38 
 
 
835 aa  138  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  35.45 
 
 
366 aa  138  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  34.63 
 
 
821 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  34.23 
 
 
842 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00676  mannose-1-phosphate guanyltransferase  32.46 
 
 
352 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  31.9 
 
 
834 aa  136  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12391  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.18 
 
 
353 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0812001  normal  0.0145083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  34.39 
 
 
818 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  32.22 
 
 
348 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.47 
 
 
842 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  32.75 
 
 
832 aa  135  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  31.7 
 
 
832 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.19 
 
 
352 aa  135  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.51 
 
 
356 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  34.09 
 
 
370 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  35.53 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  32.9 
 
 
827 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  35.75 
 
 
818 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  31.74 
 
 
352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  36.53 
 
 
810 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
830 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
712 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  33.18 
 
 
776 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  32.62 
 
 
222 aa  132  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  31.7 
 
 
833 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  34.65 
 
 
230 aa  132  6e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  34.32 
 
 
234 aa  131  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  33.79 
 
 
370 aa  131  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  31.74 
 
 
827 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.85 
 
 
392 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  35.75 
 
 
816 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  31.84 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  32.6 
 
 
357 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3126  nucleotidyl transferase  31.08 
 
 
350 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2982  nucleotidyl transferase  31.08 
 
 
350 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0566081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
381 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  32.23 
 
 
388 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.5 
 
 
837 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.61 
 
 
389 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  32.75 
 
 
828 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0072  nucleotidyl transferase  36.61 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.155346 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  34.09 
 
 
361 aa  129  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  31.82 
 
 
388 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.02 
 
 
392 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  30.64 
 
 
835 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  31.82 
 
 
388 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  35.93 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>