More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0051 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  212  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  65.35 
 
 
102 aa  138  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  63.73 
 
 
104 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  66.67 
 
 
99 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  61.47 
 
 
113 aa  130  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  60.95 
 
 
108 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  61.11 
 
 
111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  59.8 
 
 
115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  61.39 
 
 
102 aa  128  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  63.83 
 
 
105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  61 
 
 
104 aa  124  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  61.86 
 
 
102 aa  124  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  60.95 
 
 
112 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  60.95 
 
 
112 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  60 
 
 
104 aa  124  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  60.19 
 
 
103 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  59 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  58 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  59 
 
 
104 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  59 
 
 
104 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  58.25 
 
 
103 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  55 
 
 
104 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  55.34 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  54.37 
 
 
105 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  56.6 
 
 
113 aa  114  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  61 
 
 
104 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  55.67 
 
 
110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  63 
 
 
104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  51.92 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  53.47 
 
 
102 aa  110  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  57.89 
 
 
113 aa  108  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  49 
 
 
100 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  56.98 
 
 
104 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  52.53 
 
 
119 aa  103  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  49.48 
 
 
101 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  46.3 
 
 
112 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  48 
 
 
101 aa  101  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  58.1 
 
 
108 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  53.19 
 
 
99 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  56.63 
 
 
109 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  56.63 
 
 
109 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  45.63 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  55.42 
 
 
109 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  55.42 
 
 
109 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  55.42 
 
 
109 aa  98.2  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  55.42 
 
 
109 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  55.42 
 
 
109 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  55.42 
 
 
109 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  55.42 
 
 
109 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  56.63 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  46.6 
 
 
103 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  53.49 
 
 
109 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  48.08 
 
 
104 aa  92  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  47.06 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  46.08 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  44.66 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  47.92 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  46.88 
 
 
103 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  53.41 
 
 
101 aa  91.3  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  46.88 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  47 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  47.06 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  45 
 
 
98 aa  87  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  53.09 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  41.35 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  46 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  40.59 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  51.81 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  40.59 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  43.16 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  43.48 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  47.12 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  51.85 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  51.85 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  39.05 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  40.38 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
106 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  40.38 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  42.57 
 
 
109 aa  84  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  44.57 
 
 
100 aa  84  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  43.27 
 
 
118 aa  84  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  45.45 
 
 
156 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  41.18 
 
 
110 aa  84  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  41.18 
 
 
110 aa  84  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  41.35 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  41.35 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  41.35 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  41.35 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  41.35 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  41.35 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  41.35 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  41.35 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  41.35 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  41.35 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  41.35 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  41.35 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  41.35 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  42.57 
 
 
109 aa  83.6  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  42.57 
 
 
109 aa  83.6  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>