More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4892 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.44 
 
 		 698 aa  723    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.43 
 
 		 695 aa  824    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.13 
 
 		 703 aa  748    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 706 aa  1462    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.94 
 
 		 701 aa  766    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.3 
 
 		 704 aa  743    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  55.92 
 
 		 700 aa  770    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.24 
 
 		 702 aa  977    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.21 
 
 		 696 aa  905    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.8 
 
 		 702 aa  795    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.59 
 
 		 700 aa  592  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.55 
 
 		 712 aa  534  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.75 
 
 		 719 aa  531  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.17 
 
 		 817 aa  526  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.61 
 
 		 779 aa  526  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.17 
 
 		 706 aa  523  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.11 
 
 		 706 aa  523  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.46 
 
 		 786 aa  521  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.79 
 
 		 819 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.95 
 
 		 772 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.39 
 
 		 772 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.87 
 
 		 819 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.25 
 
 		 685 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.33 
 
 		 829 aa  515  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.36 
 
 		 703 aa  513  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.43 
 
 		 765 aa  511  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.9 
 
 		 767 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.33 
 
 		 818 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.15 
 
 		 689 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.35 
 
 		 714 aa  497  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.55 
 
 		 822 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.2 
 
 		 778 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.05 
 
 		 681 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.11 
 
 		 707 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.67 
 
 		 776 aa  486  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.75 
 
 		 822 aa  488  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.07 
 
 		 717 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.61 
 
 		 772 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.61 
 
 		 904 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.56 
 
 		 827 aa  487  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.61 
 
 		 827 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.41 
 
 		 805 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.76 
 
 		 692 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.07 
 
 		 812 aa  481  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.99 
 
 		 694 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.74 
 
 		 679 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.92 
 
 		 706 aa  481  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.4 
 
 		 815 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.42 
 
 		 690 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  42 
 
 		 671 aa  472  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.64 
 
 		 862 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.34 
 
 		 678 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.37 
 
 		 787 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.31 
 
 		 904 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.08 
 
 		 818 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.62 
 
 		 846 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.99 
 
 		 846 aa  469  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.07 
 
 		 846 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 		 683 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.46 
 
 		 691 aa  462  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.82 
 
 		 842 aa  463  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.81 
 
 		 842 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.8 
 
 		 686 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 		 697 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1702  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.63 
 
 		 564 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  37.1 
 
 		 818 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.37 
 
 		 688 aa  461  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.75 
 
 		 740 aa  457  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 		 799 aa  457  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.52 
 
 		 689 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.72 
 
 		 832 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.98 
 
 		 818 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.26 
 
 		 685 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.31 
 
 		 705 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.74 
 
 		 818 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.68 
 
 		 682 aa  452  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.68 
 
 		 682 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.68 
 
 		 682 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.68 
 
 		 682 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.29 
 
 		 682 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.53 
 
 		 682 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.68 
 
 		 682 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.65 
 
 		 818 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.21 
 
 		 680 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.65 
 
 		 815 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.59 
 
 		 691 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.59 
 
 		 686 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.54 
 
 		 715 aa  451  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.44 
 
 		 682 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.15 
 
 		 685 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.94 
 
 		 681 aa  449  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.01 
 
 		 672 aa  451  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.95 
 
 		 908 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 		 671 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.06 
 
 		 715 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  39 
 
 		 753 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.88 
 
 		 704 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.88 
 
 		 704 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.23 
 
 		 676 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.34 
 
 		 903 aa  447  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>