168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2419 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2419  globin  100 
 
 		 123 aa  258  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3575  hemoglobin-like protein  66.67 
 
 		 125 aa  168  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  45.53 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  42.5 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  44.44 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  43.59 
 
 		 132 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  43.59 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  43.59 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  43.59 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  43.59 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  43.59 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  43.59 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  43.59 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  43.59 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  42.74 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  42.5 
 
 		 137 aa  103  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  45.31 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  40 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  46.49 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  46.49 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  43.9 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  39.5 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  41.32 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  41.18 
 
 		 128 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  43.93 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  38.02 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  36.89 
 
 		 131 aa  87.4  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  38.84 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  38.33 
 
 		 142 aa  86.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  38.33 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  38.02 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  38.33 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  40.16 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  38.02 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  41.13 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  37.7 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  38.89 
 
 		 136 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  36.29 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  36.07 
 
 		 125 aa  84.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  34.71 
 
 		 127 aa  84.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  38.71 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  38.84 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  40.83 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  38.4 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.134199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  41.28 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  42.42 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  36.13 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  38.84 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  35.83 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  38.84 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  38.84 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  38.21 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  38.84 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  38.84 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  35.2 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  38.84 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  38.84 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  36.89 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  33.33 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  38.02 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  38.02 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  39.5 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  36.29 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  36.29 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  38.02 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  38.02 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  38.02 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  38.02 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  36.29 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  38.02 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  39.5 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  37.5 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  38.02 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  36.97 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  36.97 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  37.19 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  36.67 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4036  globin  38.71 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  38.84 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  42.71 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  36.67 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  35.48 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  36.67 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  37.19 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  40 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  36.13 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  42.71 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  33.88 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  36.97 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  35 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  42.71 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  40.62 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  34.71 
 
 		 178 aa  77  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  38.02 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  35.48 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  42.71 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  35.29 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  34.43 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  35.83 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  32.54 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.823311 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>