More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0310 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  100 
 
 		 309 aa  638    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  62.3 
 
 		 312 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  48.34 
 
 		 311 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  47.06 
 
 		 308 aa  288  9e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  50.55 
 
 		 333 aa  285  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  48.52 
 
 		 306 aa  285  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  45.18 
 
 		 302 aa  279  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  49.06 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  47.02 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  44.66 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  47.57 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  44.98 
 
 		 316 aa  271  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  42.31 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  43.26 
 
 		 302 aa  269  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  47.06 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  43.97 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  43.65 
 
 		 309 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  43.07 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  45.45 
 
 		 307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  46.49 
 
 		 271 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  46.47 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  44.3 
 
 		 307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  44.16 
 
 		 317 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  49.59 
 
 		 323 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  45.19 
 
 		 305 aa  248  9e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  41.58 
 
 		 305 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  42.34 
 
 		 301 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  42.3 
 
 		 302 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  43.06 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  43.45 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  40.2 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  41.32 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  40.3 
 
 		 277 aa  209  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  33.2 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  30.92 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  25.99 
 
 		 281 aa  89  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  26.71 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  28.02 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.89 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1373  aldo/keto reductase  30.18 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  25.84 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2291  aldo/keto reductase  31.14 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  25.9 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0446  aldo/keto reductase  28.63 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  27.47 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  27.47 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  25.82 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  31.99 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  26.39 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  23.9 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  28.31 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  26.4 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  26.53 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  26.53 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  26.53 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  26.53 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4371  aldo/keto reductase  26.64 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.53 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.12 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10217  aldo-keto reductase (AKR13), puatative (AFU_orthologue; AFUA_7G00700)  25.08 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.315653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1410  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.17 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3682  aldo/keto reductase  29.77 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1477  aldo/keto reductase  23.31 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  27.76 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  24.53 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2985  aldo/keto reductase  24.85 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  30.77 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0142  aldo/keto reductase  25.83 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  26.37 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  21.82 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  26.02 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  24.54 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2029  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.53 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.848992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  27.16 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2191  aldo/keto reductase  28.93 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  28.72 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5228  aldo/keto reductase  26.25 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  22.94 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1595  aldo/keto reductase  26.77 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2253  aldo/keto reductase  28.35 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  27.78 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1321  aldo/keto reductase  28.69 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  24.44 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  22.61 
 
 		 408 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  25.51 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  24.66 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  24.92 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  25.73 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  26.94 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  26.24 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  28.23 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1564  aldo/keto reductase  26.92 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  25 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  26.52 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2023  aldo/keto reductase  24.36 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0725313  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3009  aldo/keto reductase  28.35 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0466908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  29.12 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  22.59 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  23.13 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  23.66 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>