More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0988 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 676 aa  1350    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  54.59 
 
 		 672 aa  649    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  48.83 
 
 		 741 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  46.05 
 
 		 666 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  43.14 
 
 		 674 aa  536  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  41.96 
 
 		 636 aa  503  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  40.51 
 
 		 672 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  41.19 
 
 		 665 aa  478  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  41.11 
 
 		 666 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  42.14 
 
 		 665 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.91 
 
 		 697 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  40.28 
 
 		 656 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.7 
 
 		 671 aa  463  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  41.09 
 
 		 658 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  39.64 
 
 		 688 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  41.55 
 
 		 666 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  39.23 
 
 		 666 aa  450  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.67 
 
 		 663 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  38.69 
 
 		 670 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  35.54 
 
 		 682 aa  422  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  40.42 
 
 		 668 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  38.37 
 
 		 664 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  37.37 
 
 		 693 aa  388  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 		 664 aa  385  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  44.02 
 
 		 577 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 		 775 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 		 586 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  34.78 
 
 		 584 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  34.7 
 
 		 585 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  40.86 
 
 		 457 aa  320  7e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  34.96 
 
 		 584 aa  317  7e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  32.34 
 
 		 762 aa  316  9e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  31.91 
 
 		 771 aa  315  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  31.26 
 
 		 773 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1550  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  34.75 
 
 		 582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00125081  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  33.33 
 
 		 648 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  31.64 
 
 		 648 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  31.48 
 
 		 648 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5710  sodium/hydrogen exchanger  35.26 
 
 		 679 aa  303  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  33.13 
 
 		 648 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  31.48 
 
 		 648 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  34.27 
 
 		 674 aa  303  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  30.89 
 
 		 649 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 		 652 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  31.64 
 
 		 649 aa  301  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  31.48 
 
 		 648 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  33.13 
 
 		 648 aa  298  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  33.13 
 
 		 648 aa  298  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  30.59 
 
 		 650 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  31.79 
 
 		 649 aa  293  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 		 673 aa  292  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 671 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  31.47 
 
 		 662 aa  291  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.21 
 
 		 655 aa  290  7e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  31.67 
 
 		 649 aa  289  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  29.05 
 
 		 650 aa  289  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  33.44 
 
 		 659 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 		 667 aa  276  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 		 665 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 		 665 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  31.47 
 
 		 653 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  29.94 
 
 		 657 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  31.89 
 
 		 648 aa  270  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  30.77 
 
 		 652 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.58 
 
 		 572 aa  266  1e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  30.92 
 
 		 661 aa  266  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  30.92 
 
 		 661 aa  266  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  30.07 
 
 		 674 aa  264  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  31.27 
 
 		 567 aa  261  4e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 		 567 aa  261  4e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.14 
 
 		 567 aa  259  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.23 
 
 		 720 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  32.25 
 
 		 666 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  28.14 
 
 		 684 aa  257  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  31.15 
 
 		 666 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  31.16 
 
 		 663 aa  253  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  32.72 
 
 		 601 aa  253  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  31.24 
 
 		 668 aa  253  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  32.72 
 
 		 601 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  32.72 
 
 		 601 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  31.03 
 
 		 667 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  32.35 
 
 		 629 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 656 aa  252  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  31.25 
 
 		 666 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  32.72 
 
 		 601 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.4 
 
 		 680 aa  250  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  32.54 
 
 		 601 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  31.55 
 
 		 659 aa  250  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  31.36 
 
 		 678 aa  250  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  30.63 
 
 		 660 aa  249  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  31.85 
 
 		 659 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  30.85 
 
 		 663 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  31.08 
 
 		 668 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.89 
 
 		 669 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  31.08 
 
 		 668 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  31.08 
 
 		 668 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.89 
 
 		 669 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  30.89 
 
 		 669 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.89 
 
 		 669 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.89 
 
 		 669 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>