61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0522 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
116 aa  228  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  41.28 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  42.31 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  33.96 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  37.93 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  38.1 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  36.17 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  39.62 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2929  branched-chain amino acid transport  39.81 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.814408 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0923  branched-chain amino acid transport  40.62 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.327368  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  39.25 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1720  hypothetical protein  43.01 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000179582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  33.68 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1773  hypothetical protein  29.25 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1552  hypothetical protein  29.25 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1563  hypothetical protein  29.25 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.574296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1723  hypothetical protein  29.25 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0850  hypothetical protein  26.85 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000591245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1600  hypothetical protein  29.25 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.532771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1796  hypothetical protein  28.3 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1242  branched chain amino acid ABC transporter  37.86 
 
 
105 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0349  branched-chain amino acid transport  44.83 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1599  branched-chain amino acid transport  26.67 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  35.21 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  30.21 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  33.66 
 
 
109 aa  48.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  32.95 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  28.3 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0310  branched-chain amino acid transport  25 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1742  hypothetical protein  29.07 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3601  hypothetical protein  29.07 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  28.3 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  32 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  26.67 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1427  branched-chain amino acid transport  28.72 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0169671  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  32 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1187  branched-chain amino acid transport  28.83 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  33.8 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2350  branched-chain amino acid transport  37.04 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.771516  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1851  hypothetical protein  27.91 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1024  branched-chain amino acid transport  22.92 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0636348  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  33.8 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1929  branched-chain amino acid transport  33 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1604  branched-chain amino acid transport  23.96 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461016  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  27.62 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2050  hypothetical protein  31.37 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  32.67 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  33.75 
 
 
100 aa  42  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  33.75 
 
 
100 aa  42  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  35.62 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  33.75 
 
 
100 aa  42  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  33.87 
 
 
100 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  32.35 
 
 
100 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  35.44 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1458  branched-chain amino acid transport  35 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  28.87 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0120  branched-chain amino acid transport  32.2 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000282674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>