27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1743 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  206  7e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2050  hypothetical protein  60.38 
 
 
107 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1720  hypothetical protein  43.69 
 
 
108 aa  90.1  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000179582  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0850  hypothetical protein  31.96 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000591245  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  33.03 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  35.92 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  35.92 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1599  branched-chain amino acid transport  32.41 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1773  hypothetical protein  31.52 
 
 
103 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1563  hypothetical protein  31.52 
 
 
103 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.574296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1552  hypothetical protein  31.52 
 
 
103 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1796  hypothetical protein  31.52 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3601  hypothetical protein  32.58 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1742  hypothetical protein  32.58 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1723  hypothetical protein  31.52 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1600  hypothetical protein  31.52 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.532771  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  31.53 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1851  hypothetical protein  30.34 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  34.02 
 
 
107 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  23.81 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  26.67 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1392  branched-chain amino acid transport  34.44 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952567  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0319  branched-chain amino acid transport  31.91 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000013452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  30.11 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  31.4 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>